[发明专利]血浆DNA的建库方法和建库试剂盒有效
申请号: | 201910229527.4 | 申请日: | 2019-03-25 |
公开(公告)号: | CN109971827B | 公开(公告)日: | 2020-05-01 |
发明(设计)人: | 唐守运;曲艳;汪彪;胡玉刚;郑文莉;吴强 | 申请(专利权)人: | 纳昂达(南京)生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 路秀丽 |
地址: | 210046 江苏省南京市栖霞*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 血浆 dna 方法 试剂盒 | ||
1.一种基于MGI测序平台的血浆DNA的建库方法,其特征在于,所述建库方法包括:
对血浆DNA进行末端修复及加A,得到修复DNA;
采用带有唯一标签序列的接头对所述修复DNA依次进行接头连接和PCR扩增,得到所述血浆DNA的测序文库;所述带有唯一标签序列的接头采用A1所示的第一Y接头和B1所示的第二Y接头的混合接头;
A1:第一Y接头
B1:第二Y接头
其中,N为A、T、C或G,所述第一Y接头中的NNNNN序列与所述第二Y接头中的NNNNNN序列均代表所述唯一标签序列;
所述唯一标签序列包括下表1所示的16个所述第一Y接头的5bp标签序列和16个所述第二Y接头的6bp标签序列:
表1:
接头序号 5bp标签序列 接头序号 6bp标签序列 MGI-5bp-1 5'Phos-GCTAG-3' MGI-6bp-1 5'Phos-GACGAT-3' MGI-5bp-2 5'Phos-GAGCA-3' MGI-6bp-2 5'Phos-GCTCTT-3' MGI-5bp-3 5'Phos-AGCGT-3' MGI-6bp-3 5'Phos-CGGAAT-3' MGI-5bp-4 5'Phos-CTCCA-3' MGI-6bp-4 5'Phos-GCATGA-3' MGI-5bp-5 5'Phos-TGGAC-3' MGI-6bp-5 5'Phos-CATCAC-3' MGI-5bp-6 5'Phos-CAAGC-3' MGI-6bp-6 5'Phos-GACATC-3' MGI-5bp-7 5'Phos-TCGTG-3' MGI-6bp-7 5'Phos-CTAGTC-3' MGI-5bp-8 5'Phos-GTACG-3' MGI-6bp-8 5'Phos-CGATCG-3' MGI-5bp-9 5'Phos-CGAGT-3' MGI-6bp-9 5'Phos-CATTGC-3' MGI-5bp-10 5'Phos-GCACT-3' MGI-6bp-10 5'Phos-CTGATG-3' MGI-5bp-11 5'Phos-TACCG-3' MGI-6bp-11 5'Phos-CAACTG-3' MGI-5bp-12 5'Phos-GTCAG-3' MGI-6bp-12 5'Phos-CTCTGT-3' MGI-5bp-13 5'Phos-GACTC-3' MGI-6bp-13 5'Phos-GCCTAT-3' MGI-5bp-14 5'Phos-TGTCC-3' MGI-6bp-14 5'Phos-GCCTTA-3' MGI-5bp-15 5'Phos-ACCGA-3' MGI-6bp-15 5'Phos-GCGTAA-3' MGI-5bp-16 5'Phos-AGGGA-3' MGI-6bp-16 5'Phos-GTAACC-3'
。
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