[发明专利]一种整合多组学知识库的交互式生物信息云分析平台

权利要求书

1.一种整合多组学知识库的交互式生物信息云分析平台，其特征在于，所述交互式生物信息云分析平台包括：生物信息知识共享平台和生物信息在线分析交互平台；

生物信息知识共享平台包括：云平台模块、在线课堂模块和论坛模块；

云平台模块，用于提供生物信息分析所需的作图软件；

在线课堂模块，用于提供各项组学技术的课堂和工具软件的实操教程；

论坛模块，用于提供在线经验交流的服务；

生物信息在线分析交互平台包括：项目模块、任务模块和分析平台模块；

分析平台模块包括：微生物多样性分析平台单元、转录组分析平台单元和遗传图谱分析平台单元；

遗传图谱分析平台单元包括：第三流程分析子单元和第三结果交互分析子单元；

第三结果交互分析子单元包括：表型导入与分析组件、标记筛选过滤组件和QTL分析组件；

表型导入与分析组件，用于按照输入文件格式选择上传原始表型记录文件，并进行表型分析参数设定，来提交表型分析任务，得到处理后的表型文件；

标记筛选过滤组件，用于对处理后的表型文件进行过滤参数的设置，进行图谱标记过滤，得到处理后的基因型文件；

QTL分析组件，用于对表型文件和基因型文件进行QTL分析；

所述交互式生物信息云分析平台还包括：快捷组件；

快捷组件，用于连接到生物信息知识共享平台；

微生物多样性分析平台单元包括：第一流程分析子单元和第一结果交互分析子单元；

第一结果交互分析子单元包括：分组方案组件、OTU筛选组件、物种分类分析组件、Alpha多样性分析组件、Beta多样性分析组件和功能分析组件；

分组方案组件，用于根据实验需求将样本进行分组；

OTU筛选组件，用于按照需要筛选OTU，自动生成后续分析所需要的OTU丰度表格以对样本进行筛选，接着对筛选出的样本进行分析；

物种分类分析组件，用于对样本进行针对不同分类水平，在物种层面进行分析；

Alpha多样性分析组件，用于对样本进行α多样性指数、稀释曲线和α多样性差异分析；

Beta多样性分析组件，用于对样本进行样本距离分析、UPGMA聚类树、多元统计分析和群落结构差异分析；

功能分析组件，用于对样本进行PICRUSt、Tax4FUN和FUNGuild分析；

转录组分析平台单元包括：第二流程分析子单元和第二结果交互分析子单元；

第二结果交互分析子单元包括：总览组件、样本关系组件、基因筛选组件、差异分析组件、基本功能分析组件和高级功能分析组件；

总览组件，用于展示项目标号、样本名称、分组方案及样本间差异方案、测序数据；

样本关系组件，用于对样本进行分组并进行后续分析或样本件关系分析；

基因筛选组件，用于对样本进行基因筛选和基因序列筛选；

差异分析组件，用于对比较组样本的基因进行表达量差异分析；

基本功能分析组件，用于对样本进行GO、KEGG功能富集分析；

高级功能分析组件，用于对样本选择分组并进行参数设置后再进行趋势分析。

2.如权利要求1所述的交互式生物信息云分析平台，其特征在于，

项目模块包括：项目数据列表单元和项目搜索框单元；

项目数据列表单元，用于展示用户所要分析的所有的项目信息；

项目搜索框单元，用于对流程名称的关键字进行项目信息的查询。

3.如权利要求1所述的交互式生物信息云分析平台，其特征在于，

任务模块包括任务数据列表单元和任务搜索框单元；

任务数据列表单元，用于记录用户所进行过的所有的任务信息；

任务搜索框单元，用于对任务名称的关键字进行任务信息的查询。