[发明专利]一组检测水稻非转基因抗除草剂基因OsALS的CAPS标记引物组及其应用在审
申请号: | 201910265647.X | 申请日: | 2019-04-03 |
公开(公告)号: | CN109825629A | 公开(公告)日: | 2019-05-31 |
发明(设计)人: | 李刚;李磊;林参;袁彩勇;王健;程保山;王迪 | 申请(专利权)人: | 江苏徐淮地区淮阴农业科学研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 赵晓琳 |
地址: | 223001 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 引物组 抗除草剂基因 核苷酸序列 反向引物R 非转基因 正向引物 水稻新品种 水稻 抗除草剂 水稻育种 检测 生产成本 工作量 应用 | ||
1.一组检测水稻非转基因抗除草剂基因OsALS的CAPS标记引物组,其特征在于,所述引物组包括正向引物OsALS-F和反向引物R,所述正向引物OsALS-F的核苷酸序列如SEQ IDNO.1或SEQ ID NO.2所示,所述反向引物R的核苷酸序列如SEQ ID NO.3或SEQ ID NO.4所示。
2.根据权利要求1所述CAPS标记引物组,其特征在于,所述水稻非转基因抗除草剂基因OsALS的CAPS标记酶切位点位于水稻第2号染色体第18237999bp处,多态性表现为G/A碱基差异。
3.权利要求1或2所述CAPS标记引物组在水稻育种中的应用。
4.权利要求1或2所述CAPS标记引物组在鉴定抗咪唑啉酮类除草剂水稻品种中的应用。
5.权利要求1或2所述CAPS标记引物组在鉴定抗咪唑啉酮类除草剂水稻基因型中的应用。
6.根据权利要求3~5任一项所述应用,其特征在于,所述CAPS标记引物组通过PCR的方式进行应用。
7.根据权利要求6所述应用,其特征在于,所述PCR的方法包括以下步骤:
(1)以水稻基因组DNA为模板DNA进行PCR反应,得PCR扩增产物;
(2)将所述部分扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,剩余部分进行酶切反应;
(3)酶切所述PCR产物后琼脂糖凝胶电泳;根据所述酶切产物的带型判断OsALS的等位基因型,所述PCR扩增产物大小、内切酶种类及酶切片段大小判断方法如下表所示:
8.根据权利要求7所述应用,其特征在于,步骤(1)所述PCR的反应体系以20μL计,包括10μL 2×Taq PCR MasterMix,1μL模板DNA,正、反向引物各1μL和7μL ddH2O。
9.根据权利要求7所述应用,其特征在于,步骤(1)所述PCR的反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性45s,58℃退火45s,72℃延伸1min,34个循环;72℃延伸8min,4℃保存。
10.根据权利要求7所述应用,其特征在于,步骤(3)所述酶切的反应体系以10μL计,包括0.3μL限制酶、1μL buffer、5.7μL ddH2O和3μL PCR产物。
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