[发明专利]一组检测水稻非转基因抗除草剂基因OsALS的CAPS标记引物组及其应用在审

专利信息
申请号: 201910265647.X 申请日: 2019-04-03
公开(公告)号: CN109825629A 公开(公告)日: 2019-05-31
发明(设计)人: 李刚;李磊;林参;袁彩勇;王健;程保山;王迪 申请(专利权)人: 江苏徐淮地区淮阴农业科学研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 北京高沃律师事务所 11569 代理人: 赵晓琳
地址: 223001 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 引物组 抗除草剂基因 核苷酸序列 反向引物R 非转基因 正向引物 水稻新品种 水稻 抗除草剂 水稻育种 检测 生产成本 工作量 应用
【权利要求书】:

1.一组检测水稻非转基因抗除草剂基因OsALS的CAPS标记引物组,其特征在于,所述引物组包括正向引物OsALS-F和反向引物R,所述正向引物OsALS-F的核苷酸序列如SEQ IDNO.1或SEQ ID NO.2所示,所述反向引物R的核苷酸序列如SEQ ID NO.3或SEQ ID NO.4所示。

2.根据权利要求1所述CAPS标记引物组,其特征在于,所述水稻非转基因抗除草剂基因OsALS的CAPS标记酶切位点位于水稻第2号染色体第18237999bp处,多态性表现为G/A碱基差异。

3.权利要求1或2所述CAPS标记引物组在水稻育种中的应用。

4.权利要求1或2所述CAPS标记引物组在鉴定抗咪唑啉酮类除草剂水稻品种中的应用。

5.权利要求1或2所述CAPS标记引物组在鉴定抗咪唑啉酮类除草剂水稻基因型中的应用。

6.根据权利要求3~5任一项所述应用,其特征在于,所述CAPS标记引物组通过PCR的方式进行应用。

7.根据权利要求6所述应用,其特征在于,所述PCR的方法包括以下步骤:

(1)以水稻基因组DNA为模板DNA进行PCR反应,得PCR扩增产物;

(2)将所述部分扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,剩余部分进行酶切反应;

(3)酶切所述PCR产物后琼脂糖凝胶电泳;根据所述酶切产物的带型判断OsALS的等位基因型,所述PCR扩增产物大小、内切酶种类及酶切片段大小判断方法如下表所示:

8.根据权利要求7所述应用,其特征在于,步骤(1)所述PCR的反应体系以20μL计,包括10μL 2×Taq PCR MasterMix,1μL模板DNA,正、反向引物各1μL和7μL ddH2O。

9.根据权利要求7所述应用,其特征在于,步骤(1)所述PCR的反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性45s,58℃退火45s,72℃延伸1min,34个循环;72℃延伸8min,4℃保存。

10.根据权利要求7所述应用,其特征在于,步骤(3)所述酶切的反应体系以10μL计,包括0.3μL限制酶、1μL buffer、5.7μL ddH2O和3μL PCR产物。

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