[发明专利]一种河湖系统中泥沙溯源方法在审
申请号: | 201910265723.7 | 申请日: | 2019-04-03 |
公开(公告)号: | CN110033133A | 公开(公告)日: | 2019-07-19 |
发明(设计)人: | 李轶;顾金飞;张文龙;牛丽华;张焕军;王龙飞 | 申请(专利权)人: | 河海大学 |
主分类号: | G06Q10/04 | 分类号: | G06Q10/04;G06Q10/06;G06Q50/06 |
代理公司: | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人: | 朱海琳;董建林 |
地址: | 210000 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 泥沙 溯源 河湖系统 目标区域 点位 测序数据 底泥 微生物 基因数据库 微生物分类 稳定性分析 采集目标 底泥样品 检测结果 泥沙来源 指纹识别 河流 样品DNA 测序 判定 优化 采集 复合 上游 检测 治理 分析 开发 | ||
1.一种河湖系统中泥沙溯源方法,其特征是,包括以下步骤:
步骤1,确定泥沙溯源目标区域的源点位与汇点位;
步骤2,采集目标区域和潜在泥沙输入河流入湖口点位底泥;
步骤3,提取采集泥沙样品DNA,进行PCR扩增以及测序,并基于基因数据库进行微生物分类;
步骤4,基于LDA Effect Size(LEfSe)分析对测序数据进行优化;
步骤5,将经过优化的测序数据、源和汇点位安排输入微生物溯源模型中进行检测,得到各潜在河流入湖口泥沙微生物对目标区域底泥微生物的贡献比例;
步骤6,对步骤5中检测结果进行稳定性分析,对不符合要求的,需要重新采样分析,即重复步骤3至步骤6的操作;
步骤7,根据判定方案,判别目标区域泥沙输入的主要贡献河流;
步骤8,结合复合指纹识别法识别河流的上游泥沙来源类别和区域。
2.根据权利要求1所述的一种河湖系统中泥沙溯源方法,其特征是,步骤1中根据河湖系统流域环境污染物现状调查,明确需要泥沙溯源的河湖系统区域及点位,根据河湖系统流域自然地理特征,流域水系,水文水资源状况,明确泥沙溯源目标区域泥沙的潜在输入河流。
3.根据权利要求1所述的一种河湖系统中泥沙溯源方法,其特征是,步骤3中采用基于Illumina Miseq平台的高通量测序,采用Silva数据库针对16S rRNA进行比对分类。
4.根据权利要求1所述的一种河湖系统中泥沙溯源方法,其特征是,步骤4中优化方法如下:使用LEfSe分析用来辨别泥沙溯源目标区域和潜在输入河流的入湖口区域两个分组中泥沙微生物在丰度上有显著差异的物种,将其确定为所在区域的土著微生物,在将测序数据输入微生物溯源模型时予以去除。
5.根据权利要求1所述的一种河湖系统中泥沙溯源方法,其特征是,步骤5中采用的微生物溯源模型为SourceTracker。
6.根据权利要求1所述的一种河湖系统中泥沙溯源方法,其特征是,步骤6中稳定性分析采用重复多次检测结果的标准差和SD和相对标准差RSD来评估模型稳定性。
7.根据权利要求1所述的一种河湖系统中泥沙溯源方法,其特征是,步骤7中判定方案如下:
a.当潜在河流的泥沙微生物贡献比例A<10%时,判断该河流为贡献较少河流,无需判别河流的上游泥沙来源类别和区域;
b.当10<A<20%时,判断该河流为次要贡献河流,根据实际情况判断是否需要判别河流的上游泥沙来源类别和区域;
c.当A>20%时,判断该河流为主要贡献河流,需要判别河流的上游泥沙来源类别和区域。
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