[发明专利]一种用于鉴定苹果新品种“赤霞”指纹图谱的SSR分子标记及其应用在审

专利信息
申请号: 201910270157.9 申请日: 2019-04-04
公开(公告)号: CN109825636A 公开(公告)日: 2019-05-31
发明(设计)人: 侯丽媛;邓舒;张春芬;肖蓉;曹秋芬;赵菁 申请(专利权)人: 山西省农业科学院生物技术研究中心;山西省农业科学院果树研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 太原晋科知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 14110 代理人: 王瑞玲
地址: 030031 山*** 国省代码: 山西;14
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摘要:
搜索关键词: 苹果新品种 指纹图谱 分子遗传学 共显性标记 创新技术 分子标记 种质资源 属植物 应用 种质 新品种 苹果
【权利要求书】:

1.一种鉴定苹果新品种‘赤霞’的SSR分子标记,其特征在于:所述分子标记为如下所示的14对SSR标记,分别为:SSR标记CH01d08,SSR标记CH01f02,SSR标记CH01f07a,SSR标记CH02b10,SSR标记CH02d08,SSR标记CH02c02a,SSR标记CH05e03,SSR标记Hi03a10,SSR标记Hi04a05,SSR标记Hi23d06,SSR标记GD 12,SSR标记GD 142,SSR标记GD 147,SSR标记NH009b;用于扩增上述标记的引物分别为:

SSR标记CH01d08核苷酸序列如SEQ ID No.1、2所示;

SSR标记CH01f02核苷酸序列如SEQ ID No.3、4所示;

SSR标记CH01f07a核苷酸序列如SEQ ID No.5、6所示;

SSR标记CH02b10核苷酸序列如SEQ ID No.7、8所示;

SSR标记CH02d08核苷酸序列如SEQ ID No.9、10所示;

SSR标记CH02c02a核苷酸序列如SEQ ID No.11、12所示;

SSR标记CH05e03核苷酸序列如SEQ ID No.13、14所示;

SSR标记Hi03a10核苷酸序列如SEQ ID No.15、16所示;

SSR标记Hi04a05核苷酸序列如SEQ ID No.17、18所示;

SSR标记Hi23d06核苷酸序列如SEQ ID No.19、20所示;

SSR标记GD 12核苷酸序列如SEQ ID No.21、22所示;

SSR标记GD 142核苷酸序列如SEQ ID No.23、24所示;

SSR标记GD 147核苷酸序列如SEQ ID No.25、26所示;

SSR标记NH009b核苷酸序列如SEQ ID No.27、28所示。

2.利用权利要求1所述的鉴定苹果新品种‘赤霞’的SSR分子标记构建指纹图谱,其特征在于:具体方法为:以苹果新品种‘赤霞’基因组DNA为PCR扩增模板,分别以所述SSR分子标记为引物对,进行PCR扩增,用2%的琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物,在紫外观测仪上观察电泳结果;用QIAxcel Advanced全自动实时毛细管电泳系统进行分析检测,并读取相应数据,获得指纹图谱。

3.根据权利要求2所述的利用鉴定苹果新品种‘赤霞’的SSR分子标记构建指纹图谱,其特征在于:PCR扩增反应体系为20 μL,其中含10 × PCR Buffer 2.0 μL、2.5 mM 的dNTPsmixture 1.6 μL、10 ng/μL 的Primers F 0.15 μL、10 ng/μL 的Primers R 0.15 μL、5U/μL 的Taq 聚合酶0.2 μL、100ng/μL 的DNA模板2.0 μL,去离子水补足至13.9 μL;

PCR扩增程序为:94℃预变性2 min 30 s,94℃变性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸40s,35个循环,72℃ 10 min,4℃保存备用。

4.根据权利要求2所述的利用鉴定苹果新品种‘赤霞’的SSR分子标记构建指纹图谱,其特征在于: 琼脂糖凝胶电泳缓冲液为1×TBE缓冲液,恒定电压150 V条件下电泳约0.5 h,关闭电源,停止电泳,取出凝胶,在紫外观测仪上观察电泳结果。

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