[发明专利]一种验证营养素是否适合个性化病人的方法在审

专利信息
申请号: 201910277455.0 申请日: 2019-04-08
公开(公告)号: CN109994185A 公开(公告)日: 2019-07-09
发明(设计)人: 张红雨;程文文;朱强;全源;黄清 申请(专利权)人: 武汉百药联科科技有限公司;华中农业大学
主分类号: G16H20/60 分类号: G16H20/60
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 郝传鑫;周全英
地址: 430070 湖北省*** 国省代码: 湖北;42
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摘要:
搜索关键词: 营养素 生物标志物 位点 个性化 疾病 等位基因 验证 生物医药领域 遗传学分析 基因检测 因果方向 因果关系 因果效应 随机化 遗传学 关联 基因 考察
【说明书】:

发明涉及一种验证营养素是否适合个性化病人的方法,属于生物医药领域。本发明的方法包括以下步骤:(1)选取与疾病相关的营养素,根据遗传学分析方法,获取营养素和疾病的遗传学关联汇总数据;(2)使用孟德尔随机化方法计算营养素与疾病的因果关系;(3)获取与营养素和疾病因果方向一致且因果效应显著相关的SNP作为生物标志物,并找出生物标志物相应的等位基因位点;(4)对患有所述疾病的个性化病人进行基因检测,考察病人在生物标志物位点的基因情况,如果病人在生物标志物位点的突变为步骤(3)等位基因位点,则营养素适合病人,否则,营养素不适合所述病人。本发明方法能高效判断营养素是否适合个性化病人,且易于实现。

技术领域

本发明涉及一种验证营养素是否适合个性化病人的方法,属于生物医药领域。

背景技术

美国前总统巴拉克·奥巴马(Barack Obama)在2015年发起了“精准医疗倡议”,这是一项大胆的新举措,旨在支持研究人员、患者和医疗服务提供者共同努力,开发考虑到人们独特特点的个性化医疗(Loos,RJF.(2019).From nutrigenomics to personalizingdiets:are we ready for precision medicine?Am J Clin Nutr.109:1-2.)。营养基因组学可以被认为是精准医学的延伸,其目的是通过从个体遗传组成中制定的有针对性的营养疗法来预防、治疗和管理疾病(Bahcall,O.(2015)Precision medicine.Nature.526:335.)。它包括研究基因和饮食之间的双向关系:1)基因变异如何影响身体的营养反应(营养遗传学)和2)营养如何影响基因功能(营养基因组学)。虽然环境和生活方式都被认为与个性化营养素治疗有关,然而,是否有充分基于人类基因组视角的科学证据支持个性化推荐成为问题的关键。

多年来,精准营养的咨询领域一直致力于开发科学有效的程序,帮助人们理解和适应个性化营养素的使用对慢性疾病的影响。试图使用更精准的测量膳食摄入量、遗传易感性以及它们之间的相互作用(Guasch,F.M.,Dashti,H.S.,Merino,J.(2018).Nutritional Genomics and Direct-to-Consumer Genetic Testing:An Overview.AdvNutr.9(2),128-135)。然而,传统的流行病学研究仍然无法避免各种混杂因素的影响,如职业和环境暴露、饮食和补充使用。所以,尽管对精准营养的最初推动已经开始,但更多的工作仍需加强,从而开发一个健壮的科学框架,将其应用到造福个人和社会的实际解决方案中。

目前,随着遗传学信息的大量发表,如代谢组学、转录组学、表观遗传修饰等,使用与暴露因素相关的遗传变异作为工具变量(IV)进行孟德尔随机化(MR)方法推断因果关系成为可能(Jie,Zheng.,et al.(2017).Recent Developments in MendelianRandomization Studies.Curr Epidemiol Rep.4,330–345.)。MR方法遵循父母等位基因随机分配给后代的目的,因此不太可能受到混杂因素的干扰;并且基因型不受疾病的影响,所以也避免了反向因果偏差。MR已经发现了广泛领域的实用性。一方面,MR促进药剂的开发(即药物靶标验证,药物目标再利用和副作用鉴定),另一方面,MR成功地估计了暴露因子与疾病风险之间的无偏差关联。例如,MR研究表明肥胖可能是痛风的危险因素,而教育水平与AD风险呈负相关。因此,我们采用双样本MR分析策略,从不同样本中获取暴露因素(营养素)和结果因素(慢性疾病)的遗传学数据并推断两者之间的因果相关性。

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