[发明专利]一种用于检测带状疱疹病毒的引物探针组合物、试剂盒及方法有效
申请号: | 201910281656.8 | 申请日: | 2019-04-09 |
公开(公告)号: | CN109913589B | 公开(公告)日: | 2023-07-25 |
发明(设计)人: | 马东礼;邢志浩;姜含芳 | 申请(专利权)人: | 深圳市儿童医院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 上海申新律师事务所 31272 | 代理人: | 车超平 |
地址: | 518000 广东省深*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 带状 疱疹病毒 引物 探针 组合 试剂盒 方法 | ||
1.一种用于检测带状疱疹病毒的引物探针组合物,其特征在于,包括用于扩增目的DNA片段的如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示序列的引物和如SEQ ID No.3所示序列的探针;
所述引物探针组合物还包括用于扩增内标DNA片段的如SEQ ID No.4和SEQ ID No.5所示序列的引物和如SEQ ID No.6所示序列的探针;所述内标DNA片段的序列如SEQ ID No.7所示。
2.根据权利要求1所述的引物探针组合物,其特征在于,所述探针的5'端标记荧光基团,所述探针的3'端标记淬灭基团;其中,所述荧光基团为FAM、VIC、HEX、JOE、ROX或Cy5,所述淬灭基团为BHQ1、BHQ2或TAMRA。
3.一种含有权利要求1或2所述的引物探针组合物的用于检测带状疱疹病毒的试剂盒。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括反应液,所述反应液包括热启动酶和UNG酶。
5.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括阴性质控品和阳性质控品,所述阴性质控品为生理盐水,所述阳性质控品为带状疱疹病毒标准菌株的菌悬液。
6.一种非诊断目的的检测带状疱疹病毒的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
步骤1)样本的采集及提取,其中,所述样本在提取过程中加入内标DNA片段,所述内标DNA片段的序列如SEQ ID No.7所示;
步骤2)将提取的样本置于PCR反应体系中进行PCR扩增反应,所述PCR反应体系包括反应液A和反应液B;其中,所述反应液A包括如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示序列的引物和如SEQ ID No.3所示序列的探针以及如SEQ ID No.4和SEQ ID No.5所示序列的引物和如SEQ ID No.6所示序列的探针;所述反应液B包括热启动酶和UNG酶;
步骤3)根据扩增产物的Ct值,进行结果判定,其中:
样本Ct35且有明显S型扩增曲线,其结果为阳性;
样本Ct≥35且无明显S型扩增曲线,内标Ct35且有明显S型扩增曲线,其结果为阴性;
样本Ct≥35且无明显S型扩增曲线,内标Ct≥35且无明显S型扩增曲线,其结果为无效。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增反应程序为:50℃120s,95℃600s,1个循环;95℃15s,55℃45s,40个循环;37℃20s,1个循环。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述PCR反应体系的总体积为20μL,其中反应液A16μl;反应液B1μl;DNA模板3μL。
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