[发明专利]基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设方法及系统在审
申请号: | 201910284053.3 | 申请日: | 2019-04-10 |
公开(公告)号: | CN110021367A | 公开(公告)日: | 2019-07-16 |
发明(设计)人: | 周文霞;韩露;张永祥;高圣乔;程肖蕊;肖智勇;黄晏;刘港;王同兴 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 |
主分类号: | G16B50/30 | 分类号: | G16B50/30;G16H70/40 |
代理公司: | 北京纽乐康知识产权代理事务所(普通合伙) 11210 | 代理人: | 白明珠 |
地址: | 100850*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 综合信息库 靶标 来源数据 药物靶标 药物信息 构建 关联 标准化处理 数据类别 数据信息 可视化 整合 数据库 直观 查询 建设 展示 | ||
1.一种基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1从数据库中获取药物以及药物靶标相关数据信息,并同时整合不同来源数据;
S2将收集的不同来源数据进行标准化处理,并根据数据类别构建药物信息表单;
S3 根据药物信息表单的键值,将所有数据进行关联,构建药物综合信息库模型。
2.根据权利要求1所述的基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设方法,其特征在于,所述步骤S1中获取药物以及药物靶标相关数据信息的过程需从对应数据库中下载对应的药物关联数据文件,并对获得的文件进行解析和清洗,提取所需的信息。
3.根据权利要求1所述的基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设方法,其特征在于,所述步骤S1中整合不同来源数据,去除重复字段和冗余信息内容,对其缺失的信息进行补全。
4.根据权利要求1所述的基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设方法,其特征在于,所述步骤S1中数据库包括但不限于drugbank、chembl、TCMID、pubchem、SMPDB和KEGGdrug。
5.根据权利要求1所述的基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设方法,其特征在于,所述步骤S2中药物信息表单包括但不限于小分子药物基本信息表、中药信息表、靶标数据信息表、靶标分类数据信息表和药物-靶标相互作用信息表。
6.根据权利要求1-5任一项所述的基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设方法,其特征在于,所述步骤S3中将构建药物综合信息库模型进行展示,其中,所述展示页面包括但不限于药物识别信息、药物特性、药理信息、毒理信息、药物药物相互作用信息、参考网站外链接信息和药物靶标的网络展示。
7.一种基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设系统,其特征在于,包括:
获取模块,用于从数据库中获取药物以及药物靶标相关数据信息,并同时整合不同来源数据;
第一构建模块,用于将收集的不同来源数据进行标准化处理,并根据数据类别构建药物信息表单;
第二构建模块,用于根据药物信息表单的键值,将所有数据进行关联,构建药物综合信息库模型。
8.根据权利要求7所述的基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设系统,其特征在于,所述获取模块中获取药物以及药物靶标相关数据信息的过程需从对应数据库中下载对应的药物关联数据文件,并对获得的文件进行解析和清洗,提取所需的信息。
9.根据权利要求7所述的基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设系统,其特征在于,所述获取模块中整合不同来源数据,去除重复字段和冗余信息内容,对其缺失的信息进行补全。
10.根据权利要求7-9任一项所述的基于药物及靶标信息的药物综合信息库建设系统,其特征在于,所述获取模块中数据库包括但不限于drugbank、chembl、TCMID、pubchem、SMPDB和KEGGdrug。
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