[发明专利]一种与鸡繁殖性状相关的NR3C2基因的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与鸡繁殖性状相关的NR3C2基因的分子标记及其应用。本发明根据已发表的红色原鸡序列设计一组引物NR11，分别扩增了莱芜黑鸡和海兰褐蛋鸡NR3C2基因3076bp～3846bp的一段序列，序列对比发现鸡NR3C2基因3493位点有G→A的突变，使TaqI–RFLP检测出现多态性。上述PCR产物被Tap Ⅰ限制性内切酶消化后用琼脂糖凝胶电泳检测，可以得到GG、GA、AA三种带型，其中GG基因型与高繁殖性能相关，可以为地方鸡种遗传改良奠定科学依据。

技术领域

本发明涉及一种与鸡繁殖性状相关的NR3C2基因的分子标记及其应用，属于分子遗传学领域。

背景技术

盐皮质激素受体(MR,NR3C2)是核受体超家族中的一员，该超家族是一类配体依赖性转录因子，在多细胞生物中是含量最丰富的几大类转录因子超家族之一。核受体的功能一般途径为配体与相应核受体结合诱导受体的二聚化并增强其与特定DNA序列的结合，从而激活或抑制下游基因的表达。NR3C2的表达范围很广，在肾脏极化的紧密上皮，在人类和鼠的大肠、气道、汗腺、唾液腺、肝脏、内皮的上皮组织、脂肪组织，在单核细胞、B淋巴细胞和T淋巴细胞中均有表达，另外在番鸭的肝、肾、脑、腿、胆和胸中也有表达。NR3C2分布的广泛性揭示了它功能的多样性，目前其被研究最多的功能是与人类疫病相关，比如肾细胞癌、胰腺癌、肝癌等肿瘤发生，高血压、1型假性醛固酮减少症、高原肺水肿、慢性中心性浆液性脉络膜视网膜病变等，此外NR3C2还被发现与行为异常及精神分裂等有关，近来也有研究表明NR3C2参与脂类代谢，在脂肪性肥胖中发挥作用。在动物中，NR3C2的相关研究并不多，研究表明其表达水平在番鸭不同行为状态下存在差异，其单核苷酸变异与猪的肥胖相关，对内洛尔牛的研究表明，其单倍型与肉牛的肉色、烹饪损失、肌肉糖原含量和血浆促肾上腺皮质激素浓度等肉质性状相关，在鸡上目前未发现有相关研究报道。

鸡NR3C2位于4号染色体上，共有8个外显子组成，编码981个氨基酸。鉴于其在其他物种中的广泛作用，发明人围绕鸡NR3C2基因开展了相关研究，研究表明NR3C2基因与鸡繁殖性能相关。因此发明以山东地方鸡种和高产蛋鸡为素材，采用直接测序和PCR-RFLP技术首次对该基因进行SNP扫描，分析多态位点与鸡繁殖性状的相关性，以期挖掘该基因中与鸡繁殖性状密切相关的分子标记，为地方鸡种遗传改良奠定科学依据。

发明内容

本发明的目的是提供一种与鸡繁殖性状相关的NR3C2基因的分子标记及其应用。本发明根据已发表的红色原鸡序列设计一组引物NR11，分别扩增了莱芜黑鸡和海兰褐蛋鸡NR3C2基因3076bp～3846bp的一段序列，序列对比发现鸡NR3C2基因3493位点有G→A的突变，使TaqI–RFLP检测出现多态性。上述PCR产物被TapⅠ限制性内切酶消化后用琼脂糖凝胶电泳检测，可以得到GG、GA、AA三种带型，其中GG基因型与高繁殖性能相关，可以为地方鸡种遗传改良奠定科学依据。

本发明的技术方案是：一种与鸡繁殖性状相关的NR3C2基因的分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；在该序列的第418bp处(鸡NR3C2基因3493位点处)有G→A的碱基突变，导致TaqI-RFLP检测的多态性。

扩增上述序列的引物NR11为：

NR11F：5’-AGACAGACAGGGATAG-3’(SEQ ID No.2)；

NR11R：5’-GAGGACACTGAGTTAA-3’(SEQ ID No.3)。