[发明专利]一种水稻耐盐基因OsRR22引导引物、应用和靶点载体及靶点载体制备方法在审
申请号: | 201910288037.1 | 申请日: | 2019-04-11 |
公开(公告)号: | CN109825638A | 公开(公告)日: | 2019-05-31 |
发明(设计)人: | 刘毅;张安宁;刘国兰 | 申请(专利权)人: | 上海市农业生物基因中心 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;C12N15/66;C12N15/82;A01H5/00;A01H6/46 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 周倜 |
地址: | 200335 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 水稻耐盐 引物 靶点 基因 水稻基因组 载体制备 应用 纯合突变体 靶点序列 水稻种质 新途径 突变 种质 参考 创建 | ||
1.一种水稻耐盐基因OsRR22引导RNA靶点序列引物,其特征在于,所述的水稻耐盐基因OsRR22引导RNA靶点序列引物的核苷酸序列为:
RR22-gRT+:5’-AGAGGGATCAATTCCCCGTgttttagagctagaaat-3’
RR22-OsU6aT-:5’-ACGGGGAATTGATCCCTCTCggcagccaagccagca-3’。
2.权利要求1所述的水稻耐盐基因OsRR22引导RNA靶点序列引物在编辑水稻基因组中的应用。
3.根据权利要求2所述的水稻耐盐基因OsRR22引导RNA靶点序列引物在编辑水稻基因组中的应用,其特征在于:
所述的应用包括利用PCR扩增的方法构建权利要求1所述的引导RNA靶点序列的sgRNA表达盒;
将sgRNA表达盒装载到CRISPR/Cas9载体上,得到含靶点序列的CRISPR/Cas9-sgRNA载体;
将靶点CRISPR/Cas9-sgRNA载体转化水稻愈伤组织,得到水稻耐盐基因OsRR22突变体。
4.一种靶点CRISPR/Cas9-sgRNA,其特征在于:含有权利要求1所述的水稻耐盐基因OsRR22引导RNA靶点序列片段。
5.根据权利要求4所述的靶点CRISPR/Cas9-sgRNA载体的制备方法,包含以下特征步骤:
以pYLgRNA-OsU6a/LacZ质粒为模板,
在两个反应体系中分别进行第一轮PCR扩增:U-F和RR22-U6aT-扩增OsU6a-靶点片段,gR-R和RR22-gRT+扩增gRNA-靶点片段;第二轮PCR用U-GAL和Pgs-GAR引物扩增产生含靶点序列sgRNA表达盒,采取Gibson assembly方法组装sgRNA表达盒和CRISPR/Cas9载体。
6.根据权利要求5所述的靶点CRISPR/Cas9-sgRNA载体的制备方法,其特征在于:所述的Gibson assembly的引物为
U-F:5’-CTCCGTTTTACCTGTGGAATCG-3’
gR-R:5’-CGGAGGAAAATTCCATCCAC-3’
U-GAL:5’-ACCGGTAAGGCGCGCCGTAGTGCTCGACTAGTATGGAATCGGCAGCAAAGG-3’
Pgs-GAR:5’-TAGCTCGAGAGGCGCGCCAATGATACCGACGCGTATCCATCCACTCCAAGCTCTTG-3’。
7.根据权利要求5所述的靶点CRISPR/Cas9-sgRNA载体的制备方法,其特征在于:所述的CRISPR/Cas9载体为pYLCRISPR/Cas9Pubi-H。
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