[发明专利]一种检测ZNF384相关融合基因的试剂盒及其应用

说明书

本发明公开了一种检测ZNF384相关融合基因的试剂盒及其应用。本发明提供了一种基于TaqMan探针的多重RQ‑PCR检测ZNF384常见相关融合基因的方法，包含5种常见的伙伴基因，用于B‑ALL患者中ZNF384相关融合基因的快速准确的筛查。同时，本发明对B‑ALL的预后分层、指导治疗方式的选择以及MRD的特异性分子监测具有重要的临床应用价值。

技术领域

本发明涉及一种检测ZNF384相关融合基因的试剂盒及其应用。

背景技术

急性B淋巴细胞白血病(B-ALL)是一种起源于B淋巴细胞的恶性造血系统疾病，是成人尤其是儿童常见的急性白血病类型。尽管儿童B-ALL取得较好疗效，但是成人的疗效不能令人满意，只有30-40％患者获得长期生存。分子学异常是白血病发生和发展的基础，对白血病分子学异常的深入了解无论在其靶向治疗还是危险度指导下的分层治疗策略中均起到关键作用。

以染色体异位形成的融合基因为代表的分子学异常是B-ALL发病的常见机制。在上世纪末，BCR-ABL1、TCF3-PBX1、TEL-AML1以及MLL相关的融合基因等重现性融合基因类型在B-ALL中被确认，这些类型见于约40％的B-ALL患者中。近一个世纪以来，随着新一代测序(NGS)技术的发明和广泛应用，绝大部分B-ALL患者中已找到分子学异常，多种新的融合基因被发现，ZNF384(zinc fingerprotein 384)相关的融合基因是其中一种常见类型。

ZNF384基因位于染色体12p13，编码一种C2H2型锌指蛋白，发挥转录因子功能。2002年Martini等人首次报道在急性白血病中发现EWSR1-ZNF384和TAF15-ZNF384融合基因，之后偶有ZNF384相关融合基因个案报道，由于涉及染色体12p13的异位并不常见，因而一直未被重视，直到NGS的广泛应用于大量病例后才显示ZNF384融合基因在B-ALL中并不少见，已报道的ZNF384常见的伙伴基因包括EP300(E1A binding protein p300)、CREBBP(CREB binding protein)、TCF3(Transcription factor 3)、EWSR1(EWS RNAbindingprotein 1)和TAF15(TATA-box binding protein associated factor 15)等。当前已发表的有关ZNF384融合基因的文章以基于大样本二代测序进行的实验室研究为主，临床疗效往往仅是简单提及，因而缺乏细致的临床研究数据。此外，预后意义的结论不一致，有的结果显示预后好而有的显示无预后意义。因此，ZNF384相关融合基因在B-ALL中的预后意义有待进一步的研究。

当前，转录组测序等NGS技术应用于临床常规尚存在数据量大、分析繁琐复杂、费时等问题，因而实时定量PCR(RQ-PCR)技术检测特定融合基因是一种实用的临床常规检测技术。将基于TaqMan探针的RQ-PCR与多重PCR相结合，可以兼具多重PCR和RQ-PCR的优点，即可同时检测多种融合基因，又能够满足特异性、高敏感性及操作简便等要求，因此是ZNF384相关多种融合基因临床检测的适用方法。

发明内容

本发明的目的是提供一种检测ZNF384相关融合基因的试剂盒及其应用。

本发明提供了一种引物探针组合Ⅰ，由引物1至引物15和探针组成；

所述引物1为如下(a1)或(a2)：

(a1)序列表的序列1所示的单链DNA分子；

(a2)将(a1)经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的DNA分子；

所述引物2为如下(a3)或(a4)：

(a3)序列表的序列2所示的单链DNA分子；

(a4)将(a3)经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的DNA分子；