[发明专利]基于级联各向异性FCNN的三维脑肿瘤图像分割方法在审
申请号: | 201910313627.5 | 申请日: | 2019-04-18 |
公开(公告)号: | CN110084823A | 公开(公告)日: | 2019-08-02 |
发明(设计)人: | 赵柳;李锵;关欣 | 申请(专利权)人: | 天津大学 |
主分类号: | G06T7/12 | 分类号: | G06T7/12 |
代理公司: | 天津市北洋有限责任专利代理事务所 12201 | 代理人: | 程毓英 |
地址: | 300072*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肿瘤 网络模型 脑肿瘤 图像分割 级联 切片 分割 三维 核心网络 模型训练 图像数据 训练模型 最终结果 预测 图像 | ||
1.一种基于级联各向异性FCNN的三维脑肿瘤图像分割方法,包括以下步骤:
(1)搭建各向异性FCNN模型;
(2)进行全肿瘤网络模型训练,并分割全肿瘤,方法如下:
第1步:将3D MRI脑肿瘤图像分为2D A-plane、C-plane和S-plane切片,顺序取相同数量的A-plane、C-plane和S-plane切片分别输入各向异性FCNN并进行全肿瘤网络模型WA、网络模型WC和网络模型WS的训练;
第2步:分别使用全肿瘤训练模型WA、WC、WS对3D脑肿瘤图像数据进行预测,并将预测平均值作为判别全肿瘤的最终结果。
(3)进行肿瘤核心网络模型训练,并分割肿瘤核心,方法如下:
第1步:根据全肿瘤和肿瘤核心的位置关系,即肿瘤核心位于全肿瘤区域内,以全肿瘤在上下、左右和前后六个方向上的边界值生成分割后的全肿瘤边界框,分别对全肿瘤边界框在六个方向上做5个像素的体积扩展;
第2步:将扩展后边界框内的图像区域分为2D A-plane、C-plane和S-plane切片,顺序取相同数量的A-plane、C-plane和S-plane切片分别输入各向异性FCNN并进行肿瘤核心网络模型TA、网络模型TC和网络模型TS的训练;
第3步:分别使用肿瘤核心训练模型TA、TC、TS对3D脑肿瘤图像数据进行预测,并将预测平均值作为判别肿瘤核心的最终结果。
(4)进行增强肿瘤网络模型训练,并分割增强肿瘤,方法如下:
第1步:根据肿瘤核心和增强肿瘤的位置关系,即增强肿瘤位于肿瘤核心区域内,以肿瘤核心在上下、左右和前后六个方向上的边界值生成分割后的肿瘤核心边界框,分别对肿瘤核心边界框在六个方向上做5个像素的体积扩展;
第2步:将扩展后边界框内的图像区域分为2D A-plane、C-plane和S-plane切片,顺序取相同数量的A-plane、C-plane和S-plane切片分别输入各向异性FCNN并进行增强肿瘤网络模型EA、网络模型EC和网络模型ES的训练;
第3步:分别使用增强肿瘤训练模型EA、EC、ES对3D脑肿瘤图像数据进行预测,并将预测平均值作为判别增强肿瘤的最终结果。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)搭建的模型如下:
第1步:使用20个卷积核大小为3×3×1的片内卷积层、4个卷积核大小为1×1×3片间卷积层以及2个2D下采样层Down提取脑肿瘤图像特征,片内卷积层使用膨胀卷积,设定膨胀系数为1至3,只采用2层下采样,下采样通过采用步长为2、卷积核大小为3×3×1的卷积层实现;
第2步:引入残差结构,各向异性FCNN有10个残差块,每个残差块内都包含两个片内卷积层;
第3步:在网络不同深度处使用反卷积,将多个中间特征图像上采样到输入图像分辨率进行级联叠加,并将级联后的特征图像输入到卷积层,融合局部特征信息和全局特征信息,随后通过SoftMax层输出每个体素点分别属于脑肿瘤和背景的概率。
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