[发明专利]一种与黄瓜果实不规则条纹性状紧密连锁的SNP标记及其应用

权利要求书

1.一种SNP标记检测方法在黄瓜果实条纹性状鉴定中的应用，其特征在于，该SNP标记与黄瓜果实不规则条纹基因紧密连锁，所述的SNP标记的位点为黄瓜‘Chinese Long’基因组v2版本参考序列黄瓜1号染色体998383核苷酸位点上，具有A/G的多态性，所述的黄瓜品种为‘长春密刺’；

设计引物对，以黄瓜基因组DNA为模板进行PCR扩增，所述的引物对名称及正反向序列分别为：SF-SNPI，正向引物为：SEQ ID NO：2，反向引物：SEQ ID NO：3，扩增序列如SEQ IDNO：1所示，扩增长度为675bp，所述SNP标记位于扩增产物第440bp位点，存在A/G多态性；

所述SNP标记检测方法，包括以下步骤：

(1)提取黄瓜叶片组织样品总DNA；

(2)用已提取的黄瓜基因组DNA为模板，使用所述的引物对SF-SNPI进行PCR扩增；

(3)扩增产物进行测序，分析测序结果，分析位于扩增产物序列第440bp位点的A/G多态性；

(4)基于该位点SNP多态性判读基因型为AA、GG以及AG三种基因型；

(5)根据基因型确定黄瓜果实不规则条纹的有无：GG基因型为有不规则条纹黄瓜，AA及AG基因型为无不规则条纹黄瓜。

2.权利要求1所述的引物对在筛选黄瓜果实不规则条纹性状的辅助育种中的应用，所述引物对如序列SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3所示，使用所述的引物对进行PCR扩增，根据扩增产物判读如权利要求1所述SNP标记的基因型，根据基因型确定黄瓜果实不规则条纹的有无：GG基因型为有不规则条纹黄瓜，AA及AG基因型为无不规则条纹黄瓜，所述黄瓜品种为‘长春密刺’。