[发明专利]一种与羊肉质中水解氨基酸含量有关的羊MYOD1基因SNP标志物及其应用在审
| 申请号： | 201910318547.9 | 申请日： | 2019-04-19 |
| 公开（公告）号： | CN109852711A | 公开（公告）日： | 2019-06-07 |
| 发明（设计）人： | 魏天;曹阳;肖成;张立春;金海国;赵玉民;李欣;高一;柳俭强 | 申请（专利权）人： | 吉林省农业科学院 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京君泊知识产权代理有限公司 11496 | 代理人： | 李丹 |
| 地址： | 130000 吉*** | 国省代码： | 吉林;22 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 水解氨基酸 羊肉 特异性引物 辅助鉴定 检测 应用 试剂盒应用 性能鉴定 遗传育种 重要意义 标志物 试剂盒 外显子 羊育种 种鉴定 肉质 位点 突变 | ||
1.一种与羊肉质中水解氨基酸含量有关的羊MYOD1基因SNP标志物，该标志物为MYOD1基因chr1:47533298位点C-T的突变。
2.一种用于检测权利要求1所述的一种与羊肉质中水解氨基酸含量有关的羊MYOD1基因SNP标志物的特异性引物，其特征在于，所述特异性引物包括上游引物MYOD1F和下游引物MYOD1R，具体序列为：
MYOD1F：5′-TAAATAGCCCTGGGAGCCTAGTGTG-3′；
MYOD1R：5′-GCTCCTTGCCCTCTCGTAAAC-3′。
3.一种用于检测权利要求1所述的一种与羊肉质中水解氨基酸含量有关的羊MYOD1基因SNP标志物的检测方法，其特征在于，所述检测方法包括以下步骤：
(1)PCR扩增：以待测羊血液的基因组DNA为模板，所述MYOD1F和所述MYOD1R为引物，进行PCR扩增，获得PCR扩增产物；
所述PCR扩增的反应体系为：10μL的2×ES Taq Master Mix，0.5μL的所述上游引物MYOD1F，0.5μL的所述下游引物MYOD1R，1μL的所述模板，8μL的ddH2O；
所述PCR扩增的反应程序为：95℃预变性5min；95℃变性30s，60℃退火40s，35个循环；72℃延伸8min；
(2)鉴定PCR扩增产物：通过测序法对所述PCR扩增产物进行基因型鉴定，判定MYOD1基因外显子1第596位点的SNP标志物的基因型；如果所述PCR扩增产物自5′末端起第596位的碱基均为C，则所述待测羊的基因型为CC基因型，如果所述PCR扩增产物自5′末端起第596位的碱基为C和T，则所述待测羊的基因型为CT基因型，如果所述PCR扩增产物自5′末端起第596位的碱基均为T，则所述待测羊的基因型为TT基因型。
4.一种鉴定或辅助鉴定羊肉质中水解氨基酸含量的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中含有权利要求2所述的特异性引物。
5.根据权利要求4所述的一种鉴定或辅助鉴定羊肉质中水解氨基酸含量的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒中还含有一段对比序列，且所述对比序列为MYOD1基因外显子1第596位点上下游共862bp的基因序列。
6.权利要求1所述的一种与羊肉质中水解氨基酸含量有关的羊MYOD1基因SNP标志物在鉴定或辅助鉴定羊肉质中高水解氨基酸含量方面的应用、在选育羊肉质中高水解氨基酸含量的种羊方面的应用、在羊育种方面的应用。
7.权利要求2所述的一种用于检测羊MYOD1基因SNP标志物的特异性引物在鉴定或辅助鉴定羊肉质中高水解氨基酸含量方面的应用、在选育羊肉质中高水解氨基酸含量的种羊方面的应用、在羊育种方面的应用。
8.权利要求3所述的一种用于检测羊MYOD1基因SNP标志物的检测方法在鉴定或辅助鉴定羊肉质中高水解氨基酸含量方面的应用、在选育羊肉质中高水解氨基酸含量的种羊方面的应用、在羊育种方面的应用。
9.权利要求4或5所述的一种鉴定或辅助鉴定羊肉质中水解氨基酸含量的试剂盒，在鉴定或辅助鉴定羊肉质中高水解氨基酸含量方面的应用、在选育羊肉质中高水解氨基酸含量的种羊方面的应用、在羊育种方面的应用。
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