[发明专利]一种用于检测子宫内膜癌易感相关遗传分子标记的试剂盒

说明书

本发明公开了一种用于检测子宫内膜癌易感相关遗传分子标记的试剂盒，属于分子生物学与生物医药技术领域。所述遗传分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，在其第501位存在单核苷酸多态性：CT，即此序列的第501位的碱基包括碱基C和碱基T两种情况。本发明提供的试剂盒含有基于NANOG基因的单核苷酸多态性遗传分子标记设计的两对特异性PCR引物，遗传分子标记与罹患子宫内膜癌易感性密切关联，利用PCR技术可以有效检测NANOG基因中的单核苷酸多态性，进而预测子宫内膜癌的易感性，这对于子宫内膜癌易感人群的筛选和高危个体的检测，对子宫内膜癌进行早期预测、早期诊断和个性化治疗具有重要的临床意义。

技术领域

本发明涉及分子生物学与生物医药技术领域，具体涉及一种基于NANOG基因的SNP位点检测子宫内膜癌易感性的试剂盒。

背景技术

子宫内膜癌是世界上最常见的妇科肿瘤之一。在过去的几十年里，它的发病率一直在上升，并且有年轻化的趋势，特别是在发达国家。近年来，随着全球肥胖率的增加，中国的子宫内膜癌发病率也有所上升，2015年新确诊病例达到了63400例。根据FIGO 2009分类，80％的子宫内膜癌确诊时为临床Ⅰ-Ⅱ期，I期5年生存率为89.6％，II期下降为78.3％，III期为61.9％，Ⅳ期为21.1％。虽然早期诊断的子宫内膜癌可以通过手术加辅助放疗或化疗得以治愈，但仍有约15％的患者会复发进展。

由于发病机制复杂，子宫内膜癌的病因尚不清楚。环境因素，包括激素暴露和肥胖、异常错配修复(MMR)系统、遗传异常以及DNA和microRNA的异常甲基化，目前被认为是子宫内膜癌发生的主要机制。文献报道PTEN、β-catenin和K-ras等基因在子宫内膜癌细胞中存在基因突变，另有文献报道，个体遗传背景不同在子宫内膜癌的发病中也起着重要作用，但目前对子宫内膜癌遗传背景的研究还不够全面，不能完全解释子宫内膜癌的易感性和遗传背景之间的关系。因此，需要更为广泛的遗传背景研究，对潜在的相关基因单核苷酸多态性的鉴定有助于我们进一步全面理解子宫内膜癌的发生、发展和预后。对子宫内膜癌的早期预警和早期防治具有重要的临床应用价值，同时可以更好的用遗传分子标记对疾病进行有效监控。

Nanog是在胚胎干细胞中首次发现的一种分化同源盒结构域蛋白，在细胞自我更新和多潜能的转录调控中具有重要功能，在多能干细胞中高度表达，细胞走向分化后表达下降。虽然在正常的体细胞中表达是沉默的，但在多种类型的人类肿瘤细胞中，包括脑癌、乳腺癌、宫颈癌、结肠癌和卵巢癌等细胞中均存在NANOG基因的异常表达，并且NANOG基因的表达与肿瘤进展、耐药复发和远处转移有关。但这些研究均只停留在蛋白表达层面没有在DNA水平的遗传背景水平进行检测，而蛋白水平变化往往是细胞恶性转化后的结果，属于分子水平上的晚期事件，无法在疾病的发生阶段甚至在发生前进行检测和预警。但这提示我们如果对NANOG基因进行DNA水平遗传背景检测可能发现肿瘤早期预测的遗传分子标记。

发明内容

本发明旨在提供一种子宫内膜癌易感相关遗传分子标记，并以此开发用于检测子宫内膜癌易感性的试剂盒和检测方法，为发现子宫内膜癌易感人群和子宫内膜癌易感个体进行有效的早期诊断和个性化治疗提供有效而敏感的检测方法。

为实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

本发明提供了一种基于NANOG基因单核苷酸多态性位点的遗传分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1(rs4438116)所示，在第501位存在单核苷酸多态性：CT，即此序列的第501位的碱基包括碱基C和碱基T两种状态，相应基因型存在CC、CT和TT三种型别。

当表现为碱基C时是正常的NANOG基因遗传状态，当表现为碱基T时是子宫内膜癌高危易感的NANOG基因遗传状态。