[发明专利]一种基于逻辑回归的药物化合物药代动力学参数预测方法在审
申请号: | 201910328251.5 | 申请日: | 2019-04-23 |
公开(公告)号: | CN111833971A | 公开(公告)日: | 2020-10-27 |
发明(设计)人: | 张政 | 申请(专利权)人: | 上海云贵信息科技有限公司 |
主分类号: | G16C20/50 | 分类号: | G16C20/50 |
代理公司: | 上海宏京知识产权代理事务所(普通合伙) 31297 | 代理人: | 赵朋晓 |
地址: | 200120 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 逻辑 回归 药物 化合物 动力学 参数 预测 方法 | ||
1.一种基于逻辑回归的药物化合物药代动力学参数预测方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤一、文件输入,输入药物化合物的分子三维结构文件;
步骤二、描述子的计算,通过CDK计算分子的描述子;
步骤三、训练过程,将数据集包含文本数据和标签数据分成训练集和验证集;训练集数据训练模型,并输出参数预测模型;再采用Adam优化器优化模型,采用20期的训练优化模型;
步骤四、模型预测,用训练好的参数预测模型的描述子进行处理预测;
步骤五、参数输出,输出亲油性,溶解度,血浆蛋白结合率,透皮性质等参数信息。
2.根据权利要求1所述的一种基于逻辑回归的药物化合物药代动力学参数预测方法,其特征在于,所述步骤一中的结构文件支持SDF,MOL等格式。
3.根据权利要求1所述的一种基于逻辑回归的药物化合物药代动力学参数预测方法,其特征在于,所述步骤二中,在计算出描述子后,进行回归函数的训练。
4.根据权利要求3所述的一种基于逻辑回归的药物化合物药代动力学参数预测方法,其特征在于,所述回归函数的训练包括以下步骤:
a、将化合物的描述子信息输入,通过Tanh激活函数进行非线性处理;
b、将处理结果通过ReLU激活函数进行非线性处理;
c、训练出每个参数的回归函数模型。
5.根据权利要求1所述的一种基于逻辑回归的药物化合物药代动力学参数预测方法,其特征在于,所述步骤三中的验证集可用于对输出参数预测模型的验证。
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