[发明专利]21个微单倍型位点的复合扩增体系、下一代测序分型试剂盒及分型方法

说明书

本发明涉及分子生物学技术领域，尤其涉及21个微单倍型位点的复合扩增体系、下一代测序分型试剂盒及分型方法。该复合扩增体系中的21个微单倍型位点来自于21个常染色体，等位基因频率均衡，位点间相互独立，具有多态性、突变率低等优势。该试剂盒中包含如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.53所示的53条PCR扩增单端特异性引物，能够在同一反应体系中检测上述21个微单倍型位点。本发明所提供的复合扩增体系和试剂盒以及分型方法能够解决目前STR分型技术无法获得理想的分型结果、SNP位点数过多位可能出现等位基因丢失的技术问题。

技术领域

本发明涉及分子生物学技术领域，尤其涉及21个微单倍型位点的复合扩增体系、下一代测序分型试剂盒及分型方法。

背景技术

短串联重复序列(Short Tandem Repeats，STR)是目前法医物证实验室进行个人识别和亲缘关系鉴定的主流遗传标记，具有分布广泛、多态性高、可实现自动化分型等特点，在DNA数据库建设和司法实践中发挥着重要作用。单核苷酸多态性(Single NucleotidePolymorphisms，SNP)是基因组中单个核苷酸变异导致的序列多态性，与STR相比，突变率低、扩增片段短、在法医亲缘关系鉴定及降解检材分析上更具有优势。而且SNP还能提供祖先信息、预测个体表型特征，为案件侦破提供更多有价值的线索。虽然在法医实际检案中，STR与SNP两种遗传标记都发挥了非常重要的作用，但二者仍然存在一定的局限性。例如，对于高度降解检材、混合检材、超微量检材等，应用常规的STR分型技术往往无法获得理想的分型结果；SNP是二等位基因遗传标记，单个SNP的多态性显著低于STR，要达到与STR相似的效能，需要增加检测的SNP位点数。然而，复合过多位点可能影响位点间扩增效率均衡性，出现等位基因丢失。

发明内容

针对现有检测方法STR分型技术无法获得理想的分型结果、SNP位点数过多位可能出现等位基因丢失的技术问题，本发明提供了一种21个微单倍型位点的复合扩增体系。

以及，本发明还提供了一种21个微单倍型位点的下一代测序分型试剂盒。

以及，本发明还提供了一种21个微单倍型位点的下一代测序分型方法。

为达到上述发明目的，本发明实施例采用了如下的技术方案：

一种21个微单倍型位点的复合扩增体系，包括分别位于21个常染色体上的21个微单倍型，所述21个微单倍型的SNP位点为：

mh01-16625882/5986/6082：rs9658928/rs915311/rs11799496；

mh02-173420626/672/733：rs7571747/rs7571654/rs10195588；

mh03-76203483/585/662：rs36133796/rs13059597/rs 75922169；

mh04-154004438/489/571：rs58857469/rs55944510/rs34333259；

mh05-109298481/535/591：rs72793064/rs72660784/rs2900038；

mh06-20609220/276/401：rs67320261/rs13206468/rs12179172；

mh07-206577/644/658/772：

rs62430281/rs74195447/rs113868763/rs71536273；

mh08-427270/350/458：rs12550792/rs11136669/rs7844307；

mh09-64336444/514/516/557：