[发明专利]数字病理切片由HE染色到IHC染色的计算机自动生成方法有效
申请号: | 201910331836.2 | 申请日: | 2019-04-24 |
公开(公告)号: | CN110246116B | 公开(公告)日: | 2020-12-25 |
发明(设计)人: | 张晓璐;罗杰坚;李晶 | 申请(专利权)人: | 创新工场(北京)企业管理股份有限公司 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/194;G06T3/40 |
代理公司: | 北京中企鸿阳知识产权代理事务所(普通合伙) 11487 | 代理人: | 李斌 |
地址: | 100080 北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 数字 病理 切片 he 染色 ihc 计算机 自动 生成 方法 | ||
本发明提出了一种数字病理切片由HE染色到IHC染色的计算机自动生成方法,包括:步骤S1,获取检测者的原始HE染色病理切片图像,对HE染色病理切片图像进行预处理以得到HE染色有效组织区域;步骤S2,对HE染色有效组织区域进行网格化处理,并映射到原始HE染色病理切片图像,得到包含有效组织区域的多个HE图像小块;步骤S3,将每个HE图像小块发送至训练好的生成器,生成多个对应的IHC染色图像块;步骤S4,将多个IHC染色图像块进行拼接组装,得到IHC染色病理图像。本发明可以在只有HE染色数字切片的情况下,由计算机自动生成IHC染色的预测,为检测者在没有IHC染色实验制备的情况下提前更精准的进行定量或半定量的预判。
技术领域
本发明涉及计算机技术领域,特别涉及一种数字病理切片由HE染色到IHC染色的计算机自动生成方法。
背景技术
病理切片,是指取一定大小的病变组织,用病理组织学方法制成病理切片。通常将病变组织包埋在石蜡块里,用切片机切成薄片,再用苏木精-伊红(H-E)染色,采用显微镜进一步检查。
HE染色是用苏木素和伊红分别染上胞核和胞浆,可以区分出一般细胞的形态,在实际应用中可以鉴定组织细胞坏死、水肿、变性和炎性细胞浸润等异常病理学改变。
IHC染色是用一抗与被检测组织中目的蛋白抗原结合,然后HRP等标记的二抗与一抗进行结合,最后通过DAB显色剂反应,进而确认所要检测蛋白抗原的定位、半定量等目的。
HE染色比较粗略地辨认不同细胞形态学改变;而IHC能够针对特异性细胞标志物来检测特异性细胞的改变(数量),也可以检测细胞内细胞因子的转位、组织中一些特异性蛋白的表达的量改变。通过图像分析系统分析颜色深浅、分布的面积等进行综合分析。
病理医生观察HE染色切片后,如果要进一步观测IHC染色确认时,只能通过再次取相邻组织标本,重新IHC染色实验的方式得到。这种方式存在以下缺陷:
(1)增加了检测者的时间成本和制备费用;
(2)不同薄层切片在结构形态方面也会存在差别,会影响医生对不同染色的图像的对比分析。
因此,如何根据其中一种染色的病理切片图像自动生成对应的另外一种染色的图像的技术是检测者急需的方法。
发明内容
本发明的目的旨在至少解决所述技术缺陷之一。
为此,本发明的目的在于提出一种数字病理切片由HE染色到IHC染色的计算机自动生成方法,可以在只有HE染色数字切片的情况下,由计算机自动生成IHC染色的预测,从而为检测者在没有IHC染色实验制备的情况下提前更精准的进行定量或半定量的预判。
为了实现上述目的,本发明的实施例提供一种数字病理切片由HE染色到IHC染色的计算机自动生成方法,包括如下步骤:
步骤S1,获取检测者的原始HE染色病理切片图像,对所述HE染色病理切片图像进行预处理以得到HE染色有效组织区域;
步骤S2,对所述HE染色有效组织区域进行网格化处理,并映射到所述原始HE染色病理切片图像,得到包含有效组织区域的多个HE图像小块;
步骤S3,将每个所述HE图像小块发送至训练好的生成器,生成多个对应的IHC染色图像块;
步骤S4,将所述多个IHC染色图像块进行拼接组装,得到IHC染色病理图像。
进一步,在所述步骤S1中,所述对HE染色病理切片图像进行预处理,包括:首先将所述原始HE染色病理切片图像进行采样,然后对采样后的图像从RGB图像空间转换至LUV颜色空间,再去除所述原始HE染色病理切片图像的背景,得到HE染色有效组织区域。
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