[发明专利]一种与辣椒辣味性状相关的InDel标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与辣椒辣味性状相关的InDel标记及其应用，公开了与辣椒果实辣味性状相关的插入/缺失片段，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述片段序列位于调控辣椒素生物合成关键MYB转录因子Cap1基因上游；同时基于此，开发了一种InDel分子标记，通过检测Cap1基因上游SEQ ID NO:1序列存在与否，可以对辣椒素类物质含量高低进行良好的分型。本发明对于辣椒辣味的遗传改良，提高育种效率，节约育种成本具有非常重要的指导意义。

技术领域

本发明涉及辣椒育种技术领域，更具体地，涉及一种与辣椒辣味性状相关的InDel标记及其应用。

背景技术

辣椒素和二氢辣椒素，及其类似物统称为辣椒素类物质是辣椒属植物特有的一类次生代谢产物，是辣椒果实品质重要的组成部分，决定果实的辣味。辣椒素类物质在食品、医药（止痛、抗癌、减肥、降血压、杀菌和健肠胃等）、军事（作催泪弹和防卫武器的原料）、化工等领域具有广泛用途。目前，世界上对辣椒素的市场需求量每年约7万吨左右，年需求总值高达175亿元，而世界总生产能力每年不足0.5万吨，需求缺口高达80%以上。辣椒素类物质需要从辣椒果实中提取，生产提取过程中90%以上的成本为原料成本，因此，应用辣椒素含量高，抗病丰产的品种就成为辣椒素类物质提取的技术关键。在目前常见的5个辣椒栽培种中C. chinense辣椒素类物质含量显著高于其他4个种（C. annuum、C. baccatum、C. frutescens、C. pubescens）。然而，C. chinense种普遍存在生育周期长、座果率低、环境适应能力弱等特点。C. annuum种座果率高、品种丰富、环境适应能力强，栽培面积广（辣椒栽培面积的85%为该种），但该种辣椒素含量低，因此对该种采用种内杂交策略以提高后代辣椒素含量能力非常有限。C. chinense和C. annuum亲缘关系很近，通过常规杂交育种方法将控制的C. chinense材料高辣椒素含量的遗传位点转移到C. annuum材料获得高辣、高产、优质、适应性强的种质资源，是选育适合辣椒素加工和提取新品种的重要前提。然而传统选育方法存在表型鉴定不稳定、耗时、费力、花费高昂等缺点。

而且传统检测辣椒素类物质的方法主要是先提取辣椒中的辣椒素物质，再采用液相色谱、质谱等方法进行测定，不仅费时费力，且成本高，效率低。而利用目标性状共分离的分子标记进行分子辅助育种具有高效、快速、稳定等优点，可以在苗期对目标性状进行提前鉴定，因此可以在一定程度上克服传统常规育种周期长，占地大，花费多等诸多限制。插入/缺失多态性（insertion/deletion，InDel）是由于等位基因位点处的DNA序列在不同个体间发生了核苷酸片段的插入/缺失而产生的长度多态性变异。在整个基因组中，InDel标记的多态性频率仅次于SNP标记，远高于SSR标记。InDel标记多态性可通过聚合酶链式反应（PCR）和琼脂糖凝胶电泳或非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳等简单的步骤达到基因分型的目的。专利CN201811285982.8公开了一种辣椒杂交种纯度的InDel标记，专利CN201810360454.8与CN201810499212.7均公开了一个用于区分五个辣椒栽培种的InDel标记；然而目前还未见有用于区分辣椒素类物质含量高低的分子标记的相关报道。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术中的上述不足，提供一种与辣椒辣味性状相关的InDel标记。

本发明的另一目的在于提供检测所述InDel标记的引物。

本发明的再一目的在于提供一种筛选辣椒素含量高低性状的方法。

本发明的上述目的是通过以下技术方案给予实现的：