[发明专利]一种用于四肢软组织肉瘤病人的肺转移预测方法有效
申请号: | 201910350067.0 | 申请日: | 2019-04-28 |
公开(公告)号: | CN110084800B | 公开(公告)日: | 2021-03-16 |
发明(设计)人: | 邓金;曾卫明;石玉虎;李颖;鲁佳 | 申请(专利权)人: | 上海海事大学 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06K9/62;G06K9/32;G06K9/46 |
代理公司: | 上海元好知识产权代理有限公司 31323 | 代理人: | 徐雯琼;张妍 |
地址: | 201306 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 四肢 软组织 肉瘤 病人 转移 预测 方法 | ||
1.一种用于四肢软组织肉瘤病人的肺转移预测方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1,采集四肢软组织肉瘤患者的临床数据和PET图像数据;
S2,对采集到的PET图像数据与预先标定的肿瘤区域进行融合得到感兴趣的区域,同时计算SUV,对临床数据进行合并整理,所述SUV为标准摄取值;
S3,对所述的感兴趣的区域进行特征提取,并利用one-hot编码方法对临床数据进行文本特征提取;
S4,合并所有特征,并利用随机森林算法及双样本T检验算法对所有特征进行特征贡献度排序;
S5,选取贡献度高的特征,利用反向传播神经网络构建四肢软组织肉瘤患者的肺转移预测模型;
所述的步骤S2包括如下步骤:
S2.1,对采集到的数据提取肿瘤区域数据,具体为:对于每个被试,利用专业医生勾勒的肿瘤区域,定位四肢软组织肉瘤患者PET影像的原始数据中的肿瘤体素区域,所述的肿瘤体素区域记为感兴趣的区域,然后提取每个被试的感兴趣的区域;
S2.2,计算感兴趣的区域中的SUV,同时对所有临床数据进行合并整理;
所述的步骤S3包括:
S3.1,提取PET图像的SUV特征,所述的SUV特征包括SUVmax、SUVpeak、SUVmean、AUC-CSH和PercentInactive,其中SUVmax表示肿瘤区域的最大SUV值;SUVpeak表示肿瘤区域与其相邻居之间平均值,取最大值;SUVmean表示肿瘤区域的平均SUV值;AUC-CSH表示累积标准摄取值体积直方图曲线下面积,描述总肿瘤体积百分比超过最大SUV阈值的百分比;PercentInactive表示不活跃肿瘤区域的百分比;
S3.2,对临床数据进行文本特征提取:利用one-hot编码方法对临床文本信息进行特征提取,所述的临床文本信息包括:年龄、性别、生存状态、肿瘤分化水平、肿瘤类型、肿瘤位置或治疗方式中的一种或几种;所述的步骤S4包括:
S4.1,融合所有特征将其合并得到特征矩阵,其中行为样本,列为所有的特征,最后一列表示每个被试是否肺转移的标签,肺转移为1,非肺转移为0,基于特征矩阵和每个被试的标签,利用重采样方法对所有被试进行随机划分N组,划分每组中一部分的数据作为袋内数据,即训练集,剩下一部分的数据作为袋外数据,即测试数据;
S4.2,N组数据即对应随机森林中的N颗决策树,对于每一颗决策树,使用相应的袋外数据来计算它的袋外数据误差,记为err1 ;
S4.3,随机地对袋外数据所有样本的特征M加入噪声干扰,再次计算该颗决策树的袋外数据误差,记为err2 ,因此,对于特征M的重要性可计算为IM=∑(err1-err2)/N,其中IM值越大,则特征M的重要性更高,对预测模型的贡献度更高。
2.如权利要求1所述的用于四肢软组织肉瘤病人的肺转移预测方法,其特征在于,所述的步骤S5包括:
S5.1,将所有的被试随机分为三组,包括训练集、测试集和验证集;
S5.2,基于随机森林挑选出的高贡献度的特征,构建BP神经网络模型,输入层神经元数目为特征个数,设置隐层神经元数目,输出层的神经元个数为标签类型数量,设置最高迭代次数、最小梯度、初始参数随机及激活函数;
S5.3,随机打乱样本顺序,重复步骤S5.1和步骤S5.2的操作N次,其N次的均值作为模型性能结果,以避免局部最优,其中训练集、验证集和测试集准确率、敏感性和特征性最高的模型即为最终的预测模型,选取其中性能最好的模型作为最终的预测模型。
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