[发明专利]用于河鲀的物种鉴定的SNP分子标记组合在审
申请号: | 201910355432.7 | 申请日: | 2019-04-29 |
公开(公告)号: | CN110241225A | 公开(公告)日: | 2019-09-17 |
发明(设计)人: | 张瀚元;许建 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 北京远大卓悦知识产权代理事务所(普通合伙) 11369 | 代理人: | 史霞 |
地址: | 100039 北京*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 物种鉴定 物种 苗种 东方鲀 父母本 分型 杂交种 暗纹东方鲀 红鳍东方鲀 菊黄东方鲀 食品安全 物种信息 准确度 基因组 可食用 养殖户 组合本 可食 星点 追溯 杂交 覆盖率 检测 清晰 养殖 群体 合法 保证 | ||
本发明公开了一种用于河鲀的物种鉴定的SNP分子标记组合,包括:双斑东方鲀鉴定的SNP分子标记组合;菊黄东方鲀鉴定的SNP分子标记组合;星点东方鲀鉴定的SNP分子标记组合;红鳍东方鲀鉴定的SNP分子标记组合;暗纹东方鲀鉴定的SNP分子标记组合。本发明还公开了一种利用不同的SNP分子标记组合用于河鲀物种、河鲀苗种的物种、杂交河鲀的父母本的物种鉴定的方法。本发明对河鲀的物种鉴定,可确保检测河鲀为合法可食用河鲀物种;对河鲀苗种的物种鉴定,可确保苗种为可食河鲀物种,保证养殖户利益和食品安全;对河鲀的杂交种的物种鉴定,使养殖河鲀群体能够清晰追溯父母本物种信息。SNP分子标记数量大、基因组覆盖率高,分型操作简单快速,分型准确度高。
技术领域
本发明涉及河鲀种质鉴定领域,具体是一种用于河鲀的物种鉴定的SNP分子标记组合。
背景技术
河鲀,属硬骨鱼纲(Osteichthyes)、辐鳍亚纲(Actinopterygii)、鲀形目(Tetraodontiformes),是一类肉质鲜美、营养价值和经济价值很高的鱼类,兼具食用性和药用性。河鲀体呈圆筒形,体背灰褐,腹面白色,体背、侧面的斑纹随种类不同而各异,有气囊,体内含有一种生物碱--河鲀毒素。我国有鲀科鱼类54种,其中可食用品种21种。可食用的河鲀主要集中在鲀亚目(Tetraodontoidei),常见的有鲀科(Tetraodontidae)东方鲀属(Takifugu)的双斑东方鲀(Takifugu bimaculatus)红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)、暗纹东方鲀(Takifugu obscurus)、菊黄东方鲀(Takifugu flavidus)、星点东方鲀(Takifuguniphobles)、黄鳍东方鲀(Takifugu xanthopterus)等。
自2016年9月起,我国有条件放开养殖红鳍东方鲀和暗纹东方鲀加工经营,显著推动了河鲀产业的发展。但不规范的养殖仍会给河鲀养殖产业和食用河鲀带来隐患。由于河鲀具有毒性的特殊性,目前,我国食用河鲀的养殖采用控毒养殖,根据毒素来源和富集原理,把控饵料,截断生产毒性的毒素,使其达到无毒级别,再经过严格的加工处理,保障河鲀的食用安全。人工养殖的红鳍东方鲀和暗纹东方鲀经过长期严格选育,能够达到安全食用的无毒水平。但在沿海地区,多种东方鲀栖息海区、繁殖季节相近,易发生种质混交,导致种质不纯。另外国内近些年也开展了一定数量的杂交种养殖,如菊黄与红鳍杂交,菊黄与暗纹杂交,红鳍与假睛杂交等。如果杂交河鲀品种和来源不明,很有可能使杂交种存在毒性风险,误食有毒河鲀对人体十分危险。另外,不同河鲀物种之间经济价值差异较大,亟待开展河鲀物种和苗种的鉴定工作。其意义,一是避免毒性较高的物种造成种间污染,造成有毒河鲀的误食,二是保证养殖品种的纯度,避免种质不纯,保证优良品种的特性,保障养殖户的利益。
因此,本发明开发简单高效的遗传工具,可用于河鲀的物种鉴定、苗种鉴定和杂交种鉴定,为优选纯种苗种进行养殖、避免种质混淆、维持养殖群体的纯度提供技术保证。
发明内容
本发明的一个目的是解决至少上述问题,并提供至少后面将说明的优点。
本发明还有一个目的是提供用于河鲀的物种鉴定的SNP分子标记组合。本发明提供用于河鲀鱼物种鉴定的SNP分子标记组合,所述SNP分子标记组合为:碱基序列如ID:Fugu001~Fugu110。本发明提供的SNP分子标记组合用于五种河鲀鱼类,结果准确,可高效率、高通量、应用简便的鉴定河鲀物种。
本发明还有一个目的是提供利用用于河鲀的物种鉴定的SNP分子标记组合进行河鲀物种鉴定的方法。
本发明还有一个目的是提供利用用于河鲀的物种鉴定的SNP分子标记组合进行杂交河鲀的父母本的物种鉴定的方法。
本发明还有一个目的是提供利用用于河鲀的物种鉴定的SNP分子标记组合进行河鲀苗种的物种鉴定的方法。
为了实现根据本发明的这些目的和其它优点,提供了用于河鲀的物种鉴定的SNP分子标记组合,包括:
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