[发明专利]一种试剂盒及其用于定量检测Leber遗传性视神经病突变体的应用在审
申请号: | 201910370501.1 | 申请日: | 2019-05-05 |
公开(公告)号: | CN110172506A | 公开(公告)日: | 2019-08-27 |
发明(设计)人: | 黄轶;薛炳乾;王欣;叶庭菠;李锐;黄道超;徐小惠 | 申请(专利权)人: | 重庆医科大学附属儿童医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 重庆弘旭专利代理有限责任公司 50209 | 代理人: | 文巍 |
地址: | 400014 *** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 遗传性视神经病 定量检测 种试剂盒 拷贝数 突变体 线粒体基因 程度判断 辅助诊断 高危人群 患者疾病 人口素质 社会意义 突变类型 突变位点 遗传咨询 试剂盒 野生型 筛查 突变 应用 诊断 分析 发现 | ||
本发明提供了一种试剂盒及其用于定量检测Leber遗传性视神经病突变体的应用。所述试剂盒包括SEQ ID NO.1~6。本发明针对LHON线粒体基因的3种高频突变位点,建立了一种既可鉴定突变类型,还可分析突变mtDNA拷贝数/野生型的拷贝数比例的定量方法,一方面在发现高危人群,并进行有效的产前遗传咨询及诊断、婚前筛查,提高人口素质方面具有极其重要的社会意义,还可为LHON临床早期临床诊治,患者疾病严重程度判断提供临床辅助诊断依据。
技术领域
本发明涉及生物医学领域,具体涉及一种试剂盒及其用于定量检测Leber遗传性视神经病突变体的应用。
背景技术
Leber遗传性视神经病变是一种最常见的线粒体基因遗传病,以母系遗传为特征,主要引起视盘及视盘黄斑纤维视神经退行性病变。常于15-35岁发病,是迄今临床上最常见导致青壮年致盲的遗传性视神经疾病之一。不完全外显和性别偏好是该病的两大特性。
目前已知线粒体DNA(mt DNA)突变位点:G3460A,G11778A与T14484C是与LHON致病相关的三个主要的原发突变位点(占总突变的95%),上述突变均可引起编码线粒体酶复合物I蛋白亚基结构的改变,削弱复合物I与辅酶Q之间的相互作用从而影响电子从复合物I向辅酶Q传递。
最近的研究表明,突变mtDNA的拷贝数与野生型的拷贝数比例与LHON疾病的显性率密切相关。因此进一步确定突变mtDNA拷贝数/野生型拷贝数比例,对LHON疾病严重程度的临床诊断具有重要的意义。
目前已有一些方法对对LHON mtDNA位点突变进行了筛查分析,如SSCP-PCR、RFLP-PCR以及DNA测序等等,但是存在费用昂贵、手续复杂、耗时长,且不可定量的问题。
发明内容
本发明的目的在于提供一种定量分析Leber遗传性视神经病变突变mtDNA拷贝数的试剂盒,能够一次鉴定突变的位点,突变是纯合子还是杂合子,以及突变和正常mtDNA拷贝数。
本发明的目的是通过以下措施实现的:
一种检测Leber遗传性视神经病试剂盒,包括SEQ ID NO.1~6。本发明的设计针对LHON致病相关的三个主要的原发突变位点:G3460A,G11778A与T14484C的探针。本发明的探针片段较普通探针短,对单个碱基的识别能力更强,15-17个碱基长度的探针足够完全特异地识别单个碱基的突变;且非荧光淬灭基团本身不发出荧光,所以该探针的本底信号极弱,从而大大加强了反应的灵敏度。同时,本发明的荧光报告基团经过精心挑选,荧光信号互不干扰,可以同时进行三重荧光识别,简化了实验流程。SEQ ID NO.1~6的各条带配比可以是SEQ ID NO.1:SEQ ID NO.2:SEQ ID NO.3=1~2:1~2:1~2,SEQ ID NO.4:SEQ ID NO.5:SEQ ID NO.6=1~2:1~2:1~2。优选配比为SEQ ID NO.1:SEQ ID NO.2:SEQ ID NO.3:SEQID NO.4:SEQ ID NO.5:SEQ ID NO.6=1~2:1~2:1~2:1~2:1~2:1~2。更优选配比为SEQ ID NO.1:SEQ ID NO.2:SEQ ID NO.3:SEQ ID NO.4:SEQ ID NO.5:SEQ ID NO.6=1:2:1:1:1:2。
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