[发明专利]以高分辨率熔解曲线为基础的寨卡病毒检测试剂盒及其检测方法在审
申请号: | 201910373407.1 | 申请日: | 2019-05-07 |
公开(公告)号: | CN110229931A | 公开(公告)日: | 2019-09-13 |
发明(设计)人: | 滕新栋;陈晓光;郑健;董梅;程晓兰;梁洁;张瑾;张涛;姜华;刘海江;朱可;张娟;郭宁;顾长美 | 申请(专利权)人: | 山东国际旅行卫生保健中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 266071 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 寨卡病毒 高分辨率 熔解曲线 检测 检测试剂 核酸检测领域 特异性引物 后处理 单个碱基 序列设计 核酸 优化 | ||
1.以高分辨率熔解曲线为基础的寨卡病毒检测特异性引物,其特征是,序列如下:
NS3-F:5’- GCTATGGGATGTGCCTGCTC -3’;
NS3-R:5’- TCCCTTCACCGCTTCTCA -3’。
2.以高分辨率熔解曲线为基础的寨卡病毒检测试剂盒,其特征是,它包括如下成分:
1)寨卡病毒NS3基因的特异性引物
NS3-F:5’- GCTATGGGATGTGCCTGCTC -3’
NS3-R:5’- TCCCTTCACCGCTTCTCA -3’。
2)PCR混合液:FastStart Taq DNA聚合酶,反应缓冲液,dNTP混合液,ResoLight饱和荧
光染料;
3)寨卡病毒基因组;
4)ddH2O;
5)25 mM MgCl2。
3.以高分辨率熔解曲线为基础的寨卡病毒检测方法,其特征是,它包括如下步骤:
1)高分辨率熔解曲线模板寨卡病毒基因组RNA的制备
使用TaKaRa MiniBEST Viral RNA/DNA Extraction Kit Ver.5.0试剂盒(TaKaRa公司),参照试剂盒说明提取寨卡病毒基因组RNA,
2)寨卡病毒基因组RNA逆转录成cDNA
使用PrimeScript™ II 1st Strand cDNA Synthesis Kit试剂盒(TaKaRa公司),参照试剂盒说明将寨卡病毒基因组RNA逆转录成cDNA,
3)高分辨率熔解曲线反应体系:
30μL反应体系包括:FastStart Taq DNA聚合酶0.5μL,DNA模板2μL,dNTP混合液2μL,ResoLight饱和荧光染料1μL,NS3-F引物1μL,NS3-R引物1μL,反应缓冲液3 μL,25 mM MgCl23.6 μL,ddH2O 15.9 μL,
4)高分辨率熔解曲线反应程序:
94℃预变性5 min,94℃变性30s,52 ℃退火30s,72℃延伸1min,共30个循环,72℃延伸5min,
PCR结束后直接运行高分辨率熔解曲线,95℃变性1min,40℃降温1min,65-95℃连续升温(每次升温1℃,收集25个荧光信号),40℃冷却10s,使用LightCycler® 480 GeneScanning Software 软件分析高分辨率熔解曲线。
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