[发明专利]一种曲霉菌分种检测的引物探针组合、试剂盒、检测方法及其应用在审
申请号: | 201910375749.7 | 申请日: | 2019-05-07 |
公开(公告)号: | CN109943662A | 公开(公告)日: | 2019-06-28 |
发明(设计)人: | 王志贤;阎香言;盛长忠;周泽奇;粟艳 | 申请(专利权)人: | 丹娜(天津)生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11;C12R1/68;C12R1/67;C12R1/685;C12R1/66 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 巩克栋 |
地址: | 300467 天津市滨海新区生态城中天大道2*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 引物探针 种检测 黄曲霉 互补探针 检测探针 黑曲霉 曲霉菌 试剂盒 土曲霉 烟曲霉 霉菌 种曲 特异性引物 互补配对 一次检测 荧光通道 检测 应用 感染 | ||
1.一种曲霉菌分种检测的引物探针组合,其特征在于,包括分别针对烟曲霉、黄曲霉、黑曲霉和土曲霉的特异性引物、检测探针以及互补探针,所述互补探针与检测探针不完全互补配对。
2.根据权利要求1所述的引物探针组合,其特征在于,所述烟曲霉的特异性引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1-2所示,所述黄曲霉的特异性引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3-4所示,所述黑曲霉的特异性引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.5-6所示,所述土曲霉的特异性引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.7-8所示;
优选地,所述烟曲霉的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示,黄曲霉的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示,黑曲霉的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示,土曲霉的检测探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示;
优选地,所述烟曲霉的互补探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.13所示,黄曲霉的互补探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.14所示,黑曲霉的互补探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.15所示,土曲霉的互补探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.16所示;
优选地,所述引物探针组合还包括内参系统;
优选地,所述内参系统包括内参引物和内参探针;
优选地,所述内参引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.17-18所示;
优选地,所述内参探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.19所示。
3.根据权利要求1或2所述的引物探针组合,其特征在于,所述烟曲霉、黄曲霉、黑曲霉和土曲霉的检测探针的3’端修饰有淬灭基团,5’端修饰有荧光基团;
优选地,所述荧光基团包括ALEX-350、Alexa Fluor 488、CY3、FAM、VIC、TET、CALGold540、JOE、HEX、CALFluorOrange560、TAMRA、CALFluorRed590、ROX、CALFluorRed610、TexasRed、CALFluorRed635、Quasar670、CY5、CY5.5、LC RED640或Quasar705中的任一种或至少两种的组合;
优选地,所述检测探针3’端修饰的淬灭基团包括TAMRA、DABCYL、BHQ-1、BHQ-2、BHQ-3或Eclipse中的任一种或至少两种的组合;
优选地,所述互补探针的3’端修饰有淬灭基团;
优选地,所述互补探针3’端修饰的淬灭基团包括TAMRA、DABCYL、BHQ-1、BHQ-2、BHQ-3或Eclipse中的任一种或至少两种的组合。
4.一种曲霉菌分种检测的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括如权利要求1-3任一项所述的引物探针组合。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括阴性质控、阳性质控和辅助试剂;
优选地,所述阴性质控为含有拟南芥DNA片段的质粒,所述拟南芥DNA片段的核苷酸序列如SEQ ID NO.20所示;
优选地,所述阳性质控分别为含有烟曲霉DNA片段的质粒、含有黄曲霉DNA片段的质粒、含有黑曲霉DNA片段的质粒和含有土曲霉DNA片段的质粒;
优选地,所述烟曲霉DNA片段、黄曲霉DNA片段、黑曲霉DNA片段和土曲霉DNA片段的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.21、SEQ ID NO.22、SEQ ID NO.23和SEQ ID NO.24所示;
优选地,所述辅助试剂包括Taq酶、dNTP、MgCl2、DMSO和缓冲液;
优选地,所述缓冲液包括Tris-HCl和KCl;
优选地,所述Tris-HCl在缓冲液中的浓度为15-20mM;
优选地,所述KCl在缓冲液中的浓度为100-200mM。
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