[发明专利]与棉花矮杆和高衣分相关的SSR分子标记

说明书

本发明公开了与棉花矮杆和高衣分相关的SSR分子标记。本发明提供了一个来自于异常棉的染色体片段，为位于异常棉11号染色体上自SSR分子标记NAU2877起至SSR分子标记JAAS4311止的片段；所述SSR分子标记NAU2877的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；所述SSR分子标记JAAS4311的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。本发明所提供的染色体片段在矮杆和高衣分棉花育种中具有重要应用价值，同时本发明开发的SSR分子标记为培育能应用于生产的矮杆高衣分棉花品种提供分子基础。

技术领域

本发明涉及棉花育种领域，具体涉及与棉花矮杆和高衣分相关的SSR分子标记。

背景技术

棉花是我国重要的经济作物和纺织工业原料，在国民经济中具有不可替代的地位。近年来，随着国内外经济形势的变化和国家产业政策的调整，棉花种植面积在长江流域和黄河流域大幅下滑。主要原因如下：种植棉花较其它大田作物更费时费工，生产成本增加；城镇化、工业化进程的加快，大量劳动力向城市转移，农村劳动力短缺。因此，提高机械化水平和规模化生产是我国棉花生产发展的必由之路。在众多农艺性状中，株高是影响棉花机械化生产的重要性状之一。棉花植株高大，具有无限生长的习性。我国机械化水平较高的主产棉区-新疆全面推广“矮、密、早”的栽培模式，其中“矮”，主要采用水肥调节、化学调控和人工打顶等技术来调节。尤其是随着化学生长调节剂的出现，缩节胺被广泛应用于棉花生产，在控制株高方面发挥了重要作用。但大量缩节胺等化学试剂的使用，不仅费时费工，对环境也造成了一定程度的污染。

单株结铃数、铃重和衣分是棉花产量构成的三大因素，而衣分是决定棉纤维产量的重要因素，与纤维品质存在显著的负相关关系，所以通过传统的育种手段同步改良棉花纤维品质和提高棉花产量变得越来越困难。

前期研究中，本实验室通过远缘杂交和分子标记辅助选择等技术相结合，获得一个二倍体野生种异常棉(Gossypium anomalum)矮杆单片段代换系CSSL34，与轮回亲本陆地棉苏8289(G.hirsutum acc.Su8289)相比，节间缩短，成熟期株高在不同环境了显著降低，并且衣分明显提高，可作为棉花矮化高衣分育种和矮化、高衣分性状分子遗传机制研究的一个重要矮源。

发明内容

本发明的目的是提供一种与棉花矮杆和高衣分相关的SSR分子标记。

第一方面，本发明要求保护一个DNA片段。

本发明所要求保护的DNA片段为位于异常棉11号染色体上至少含有自SSR分子标记NAU2877起至SSR分子标记JAAS4311止的片段。

其中，所述SSR分子标记NAU2877的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示；所述SSR分子标记JAAS4311的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。

进一步地，所述DNA片段为位于异常棉11号染色体上自所述SSR分子标记NAU2877起至所述SSR分子标记JAAS4311止的片段。

第二方面，本发明要求保护含有第一方面中所述DNA片段的载体、表达盒、重组菌或转基因细胞系。

所述载体可为人工染色体载体，如细菌人工染色体或酵母人工染色体等。所述重组菌和所述转基因细胞系含有所述人工染色体载体。

第三方面，本发明要求保护第一方面中所述的DNA片段或第二方面中所述的载体、表达盒、重组菌或转基因细胞系在如下任一中的应用：

(A1)降低棉花株高和/或提高棉花衣分；

(A2)培育株高降低和/或衣分提高的棉花品种中的应用。

第四方面，本发明要求保护第一方面中所述DNA片段上的SSR分子标记或成套SSR分子标记。

本发明所要求保护的SSR分子标记为如下(a1)-(a6)中任一；所述成套SSR分子标记由如下(a1)-(a6)组成；