[发明专利]IFITM3 SNP rs12252的基因型在预测待测者免疫反应强度中的应用

说明书

本发明公开了IFITM3 SNP rs12252的基因型作为标记物在预测待测者免疫反应强度中的应用。基因组中“IFITM3 SNP rs12252的基因型为CC”的待测者接种流感疫苗后的免疫反应强度低于“IFITM3 SNP rs12252的基因型为CT或TT”的待测者。本发明具有重要的应用价值。

技术领域

本发明属于生物医学领域，具体涉及IFITM3 SNP rs12252的基因型作为标记物在预测待测者免疫反应强度中的应用。

背景技术

IFITM(IFN-inducible transmembrane)家族的分子是通过阻止病毒的进入来履行其抗病毒的功能的ISGs。IFITM3是一个很重要的抗病毒因子当小鼠缺失IFITM3这个分子时，小鼠更易感染甲型流感病毒。研究发现，IFITM3和IFITM1的抗病毒效应相比，IFITM3对于需要进入内吞体或溶酶体来完成生命周期病毒有更好的抑制作用，这类病毒包括甲型流感病毒，登革病毒以及布鲁亚病毒科的病毒等。这类病毒的复制都必须依靠内吞体的酸化度(pH6)和Rab7蛋白的活性。

IFITM3 SNP rs12252的基因型在不同国家和地区有非常明显的差别(见图1)：例如日本人群中IFITM3 SNP rs12252-CC基因型分布最多，而北欧和英国人群中没有rs12252-CC基因型。IFITM3 SNP rs12252的基因型的分布和人种密切相关，黄种人和白种人差异明显。当IFITM3 SNP rs12252的基因型为TT时，编码野生型IFITM3蛋白，野生型IFITM3蛋白定位于细胞内的内吞体；当IFITM3 SNP rs12252的基因型为CC时，编码缺失N端21个氨基酸的IFITM3蛋白，缺失N端21个氨基酸的IFITM3蛋白定位于细胞表面。

已有研究表明，IFITM3 SNP rs12252的基因型与中国人群感染流感的重症密切相关。在中国汉族人群中IFITM3 SNP rs12252-CC基因型在人群中所占比例为25％，而在感染甲型流感病毒H1N1/09的重症人群中所占的比例高达69％，该研究表明，携带IFITM3 SNPrs12252-CC基因型的人群在感染H1N1以后，更加容易发展为重症。另外，研究还表明IFITM3SNP rs12252-CC基因型还同流感病毒的易感性相关，携带IFITM3 SNP rs12252-CC基因型的人群更易感染流感病毒。IFITM3 SNP rs12252的基因型和疾病的发展程度相关，IFITM3SNP rs12252-CC基因型的人群感染HIV和H7N9疾病的发展速度都快于IFITM3 SNPrs12252-TT基因型。

疫苗接种属于获得性免疫的范畴，是人类预防和控制疾病的重要手段。但是因为疫苗的免疫原性、流行毒株与疫苗毒株的匹配程度以及疫苗的接种途径等不同，疫苗接种后所产生的保护力不同。研究表明，流感疫苗的保护率只有50％左右，有时甚至只有20-30％。开发更具保护效力的疫苗势在必行。

发明内容

本发明的目的是如何预测待测者接种流感疫苗后的免疫反应强度。

本发明首先保护用于检测人基因组中IFITM3 SNP rs12252的基因型的物质在制备预测免疫反应强度的产品中的应用。

本发明还保护用于检测人基因组中IFITM3 SNP rs12252的基因型的物质在预测免疫反应强度中的应用。

上述任一所述的应用中，如果基因组中IFITM3 SNP rs12252的基因型为CC，待测者免疫反应强度较低。如果基因组中IFITM3 SNP rs12252的基因型为CT或TT，待测者免疫反应强度较高。基因组中“IFITM3 SNP rs12252的基因型为CC”的待测者的免疫反应强度低于“IFITM3 SNP rs12252的基因型为CT或TT”的待测者。

上述任一所述的应用中，所述用于检测人基因组中IFITM3 SNP rs12252的基因型的物质可为由引物F和引物R组成的特异引物对；所述特异引物对的靶序列可含有IFITM3SNP rs12252。