[发明专利]位于猪7号染色体上与眼肌面积、眼肌厚度相关的SNP分子标记及应用

说明书

本发明属于分子生物技术和分子标记技术领域，具体涉及一种位于猪7号染色体上与眼肌面积、眼肌厚度相关的SNP分子标记及应用。所述的位于猪7号染色体上与眼肌面积、眼肌厚度相关的SNP分子标记的SNP位点对应于国际猪基因组11.1版本参考序列7号染色体上第30342161位AG突变。本发明还提供了一种用于鉴定上述分子标记的引物对。通过上述分子标记和引物对，可逐代筛选该SNP的优势等位基因，提高优势等位基因频率，提高猪眼肌面积和眼肌厚度，最终提高肉猪的经济效益，在猪遗传改良进展中有十分重要的意义。

技术领域

本发明属于分子生物技术和分子标记技术领域，具体涉及一种位于猪7号染色体上与眼肌面积、眼肌厚度相关的SNP分子标记及应用。

背景技术

我国是世界养猪生产和猪肉消费大国，无论是养殖数量还是猪肉消费量均居世界第一，猪肉消费水平在我国总体的肉类消费中占据主导地位。随着人口数量的增长，人们对畜禽农产品的需求越来越大，这要求我们要加快培育产肉更多、肉质更好的种猪品种。如果从营养调控和生产环境等外观因素上进行改善来提高肉质，效果往往不理想。事实上，遗传因素对家畜肉品质才有决定性作用。根据相关研究可知，肉质性状是受数量性状基因座控制。在影响产肉性状的因素中，增加眼肌面积和眼肌厚度可以提高胴体瘦肉率、降低背膘厚，其中眼肌面积与眼肌厚度呈正相关，并且眼肌面积和眼肌厚度均与猪肉产量相关。因此，眼肌面积和眼肌厚度与家畜的产肉性能有直接关系，是评定胴体产肉能力的主要指标。

眼肌面积是指家畜背最长肌的横断面面积，是评价产肉性状的常用指标。眼肌面积的计算方法主要有求积仪法、图像法、坐标纸法和公式法等。但眼肌面积是一个数量性状，受多个微效基因控制。之前，人们采用QTL定位和候选基因法去鉴别其中的主效基因，但是两种方法都有自己的弊端，QTL定位置信区间比较大并且会受到不同家系群体的影响，候选基因法虽然操作简单，应用性比较强，但不能检测功能未知的基因，同样不能满足应用的需求。随着猪基因组测序和高密度SNP的开发，使得全基因组关联分析(GWAS)能够对众多重要性状的候选基因进行鉴定。因此，通过GWAS分析，可以得到眼肌厚度和眼肌面积的分子标记，从而提高种猪瘦肉率，为育种工作提供帮助，提高养殖效益。

发明内容

为了克服现有技术的不足和缺点，本发明的首要目的在于提供一种位于猪7号染色体上与眼肌面积、眼肌厚度相关的SNP分子标记。

本发明的另一目的在于提供上述位于猪7号染色体上与眼肌面积、眼肌厚度相关的SNP分子标记的应用。

本发明的再一目的在于提供一种鉴定上述SNP分子标记的引物对。

本发明的第四个目的在于提供上述引物对的应用。

本发明的第五个目的在于提供一种猪的遗传改良方法。

本发明的目的通过下述技术方案实现：

一种位于猪7号染色体上与眼肌面积、眼肌厚度相关的SNP分子标记，其SNP位点对应于国际猪基因组11.1版本参考序列7号染色体上第30342161位AG突变；

所述的位于猪7号染色体上与眼肌面积、眼肌厚度相关的SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，其中序列中的M是A或G，导致猪眼肌面积和眼肌厚度的不同；

所述的位于猪7号染色体上与眼肌面积、眼肌厚度相关的SNP分子标记的SNP位点为SEQ IDNO:1序列标注位置为72位的G72-A72的核苷酸突变；

所述的位于猪7号染色体上与眼肌面积、眼肌厚度相关的SNP分子标记在鉴定猪眼肌面积、眼肌厚度相关性状和猪遗传育种中的应用；

利用上述位于猪7号染色体上与眼肌面积、眼肌厚度相关的SNP分子标记筛选高眼肌面积和眼肌厚度性状的猪品种的方法，包含如下步骤：