[发明专利]一种AFFT1细胞的构建方法有效
申请号: | 201910438763.7 | 申请日: | 2019-05-24 |
公开(公告)号: | CN110408657B | 公开(公告)日: | 2021-03-16 |
发明(设计)人: | 焦顺昌;张嵘;周子珊;解佳森;陈小彬;陈红利 | 申请(专利权)人: | 北京鼎成肽源生物技术有限公司 |
主分类号: | C12N15/90 | 分类号: | C12N15/90;C12N5/10 |
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地址: | 102200 北京市昌平区双*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 afft1 细胞 构建 方法 | ||
1.一种AFFT1细胞的制备方法,其特征在于,所述AFFT1细胞的制备包括以下步骤:
1)筛选突变位点:通过对患者外周血进行ctDNA外显子测序,或者以患者肿瘤组织进行全外显子测序,筛选出突变位点;
2)合成突变多肽:根据突变位点进行抗原表位预测,合成突变多肽;
所述抗原表位预测是以突变的氨基酸位点为中心,向两侧延伸10个氨基酸,作为潜在抗原表位;分析潜在抗原表位的IC50,将IC50<1000nM的潜在抗原表位确定为抗原表位;
3)获取AFF细胞:将外周血中的树突状细胞,采用TAX-GFP慢病毒进行感染,并选取理想的克隆作为永生DC,并负载所述突变多肽,与PBMC共孵育,获得AFF细胞;
4)获取精准多肽:用所述突变多肽作为抗原刺激所述AFF细胞,筛选获得精准多肽;所述精准多肽的评判标准:3) 设置阳性对照:T-cells+ 100 ng/mL OKT3;阴性对照:1640+10%FBS+200 U/mL IL2;阳性对照和阴性对照正常,则说明此数据可信;多肽作为抗原的以T-cells作为基线;每组实验为两个基线,高基线和低基线,两个基线的差异为系统误差;检测值高基线+系统误差即为有效的精准多肽;
5)获取AFF’细胞:以所述精准多肽负载DC细胞制备AFF’细胞;
6)以所述精准多肽作为抗原刺激所述AFF’细胞,筛选获得能够识别所述精准多肽的特异性T细胞,通过测序得到特异性T细胞的TCRβ链CDR3区序列,并将已知的一对TCRβ链CDR3区替换成所述CDR3序列;
7)获取AFFT1细胞:敲除所述患者外周血T细胞中原有的TCR基因和表面免疫抑制性信号分子PD-1,并转入步骤6)中获得的能够与精准多肽特异性结合的TCR基因,制备得到AFFT1细胞。
2.权利要求1所述制备方法,其特征在于,所述患者外周血替换为市售工程细胞系。
3.权利要求2所述制备方法,其特征在于,所述工程细胞系为H1299、H226、H358、H1563、H2228、A549、Renca、LLC小鼠Lewis肺癌细胞、CRL-6323 B16F1、CRL-2539 4T1、U14小鼠子宫颈癌细胞、BV-2小鼠小胶质瘤细胞或G422小鼠神经胶质瘤细胞。
4.权利要求1所述制备方法,其特征在于,所述敲除患者外周血细胞的TCR基因和表面免疫抑制性信号分子的方法为CRISPR技术。
5.权利要求1所述制备方法,其特征在于,所述表面免疫抑制性信号分子还包括: Tim-3、LAG3、CTLA-4、BTLA、VISTA、CD160、2B4(CD244)、TIGIT。
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