[发明专利]一种LRFFT2细胞的构建方法在审
申请号: | 201910438800.4 | 申请日: | 2019-05-24 |
公开(公告)号: | CN110205341A | 公开(公告)日: | 2019-09-06 |
发明(设计)人: | 焦顺昌;张嵘;张天赋;周子珊;解佳森;吴子明;彭刚 | 申请(专利权)人: | 北京鼎成肽源生物技术有限公司;焦顺昌 |
主分类号: | C12N15/90 | 分类号: | C12N15/90;C12N5/10 |
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地址: | 102200 北京市昌平区双*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 细胞 构建 外周血 多肽 改造 抗原表位预测 治疗实体肿瘤 筛选 慢病毒载体 免疫抑制性 特异性杀伤 外显子测序 表达基因 技术原理 抗体药物 杀伤能力 体内抑制 突变多肽 突变位点 肿瘤细胞 肿瘤组织 个体化 慢病毒 体外用 再利用 测序 体外 转染 合成 刺激 封闭 应用 | ||
1.一种LRFFT2细胞的构建方法,其特征在于,所述的构建方法包括如下步骤:
1)通过测序肿瘤细胞筛选出突变位点,以突变的氨基酸位点为中心,向两侧各延伸8个氨基酸,将这段17个氨基酸的多肽作为潜在抗原表位,使用预测软件分析潜在抗原表位的IC50,如IC50<1000nM则认为此潜在抗原表位为抗原表位;
2)使用上步软件分析任意抗原表位两两相连后接头处的IC50,IC50≥1000nM时认为是弱免疫原性,将弱免疫原性的抗原表位连接在一起,合成连接后的突变多肽的基因序列;
3)构建表达突变多肽的慢病毒载体,包装慢病毒;
4)使用所述慢病毒转染抗原递呈细胞并与PBMC共培养,获得LFF细胞;
5)所述突变多肽作为抗原刺激所述LFF细胞,通过检测IFN-γ的分泌,筛选出有效的精准多肽;
6)以所述精准多肽作为抗原刺激所述LFF细胞,对刺激后的细胞进行CD8、CD137、IFN-γ的染色,并以流式细胞仪进行分选,筛选出能够识别所述精准多肽的特异性细胞,测序并得到特异性细胞的高频TCR基因;
7)利用CRISPR技术敲除外周血T细胞中原有的TCR基因,转入上步获得的能够与精准多肽特异性结合的TCR基因,获得TCR-T细胞;
8)细胞表面免疫抑制性信号分子经抗体药物体外封闭,即得LRFFT2细胞。
2.如权利要求1所述的LRFFT2细胞的构建方法,其特征在于,所述步骤1中测序是使用人源外周血或市售工程细胞系进行ctDNA测序,或者使用肿瘤组织进行全外显子测序。
3.如权利要求1所述的LRFFT2细胞的构建方法,其特征在于,所述市售工程细胞系包括:H1299、H226、H358、H1563、H2228、A549、Renca、LLC小鼠Lewis肺癌细胞、CRL-6323B16F1、CRL-2539 4T1、U14小鼠子宫颈癌细胞、BV-2小鼠小胶质瘤细胞、G422小鼠神经胶质瘤细胞。
4.如权利要求1所述的LRFFT2细胞的构建方法,其特征在于,所述步骤2中连接抗原表位的接头处IC50要高于两侧抗原表位的IC50。
5.如权利要求1所述的LRFFT2细胞的构建方法,其特征在于,所述步骤5中抗原递呈细胞与PBMC以1:5-20的比例混合共培养。
6.如权利要求1所述的LRFFT2细胞的构建方法,其特征在于,所述步骤6中以流式细胞仪进行分选,选择CD8+CD137+或者CD8+IFN-γ+细胞。
7.如权利要求1所述的LRFFT2细胞的构建方法,其特征在于,所述细胞表面免疫抑制性信号分子包括:PD-1、Tim-3、LAG3、CTLA-4、BTLA、VISTA、CD160、2B4(CD244)。
8.如权利要求1所述的LRFFT2细胞的构建方法,其特征在于,所述抗原递呈细胞包括:
外周血单个核细胞、树突状细胞、中性粒细胞、B淋巴细胞、巨噬细胞。
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