[发明专利]一种利用高通量基因测序评估生殖道菌群健康的方法

说明书

本发明提供了一种利用高通量基因测序评估生殖道菌群健康的方法，包括生殖道菌群样品采集、样本处理及高通量基因测序处理及分析评估，通过整合和开发先进检测和诊断技术，获得精确的检测数据，同时，本发明基于检测装置的检测精确度高、标准数据库容量大，获得的数据对于健康评估的可靠性极好，同时在进行实际测量操作时，简单、快捷，这一测量方法将会引领健康产业的发展方向。

技术领域

本发明属于检测及生物治疗领域，特别涉及一种利用高通量基因测序评估生殖道菌群健康的方法。

背景技术

阴道内微生态环境对妇女健康、生殖功能、婴儿出生等都有很重要的作用，微生物导致阴道环境产生生化或炎症反应。生育期健康女性的阴道内有大量的正常寄殖菌，各种细菌通过自身产生的黏附机制与阴道上皮细胞结合，生长于阴道壁黏膜表面。

一旦受某些因素的影响，如体内雌激素含量下降、不洁性生活、致病细菌和其他病原微生物的大量侵入、长期服用抗生素、阴道外伤及手术的创伤等，都可能使阴道pH值发生改变，破坏阴道的自然防护，阴道内菌群平衡失调，因此如何精确、简单且快捷地检测到生殖道处菌群的浓度，进而对健康进行指导有深刻的意义。

发明内容

为了精确、简单且快捷地检测到生殖道处菌群的浓度，进而对健康进行指导，本发明提供了一种利用高通量基因测序评估生殖道菌群健康的方法，具体步骤为：

(1)生殖道菌群样品采集

将采集的待测生殖道处分泌物用棉签涂抹少量，不超过1/2的棉签长度，将样品棉签放置在采集试剂管中旋紧管盖，进行信息标记后，备用检测；

(2)样本处理及高通量基因测序处理

将步骤(1)中待测样品的分泌物进行预处理，获得菌群，依次通过试剂管内裂解、吸附、感应槽内洗脱、加热槽内干燥、吸脱管内抽提进行基因组DNA提取处理，同时采用PCR仪、酶标仪、Agilent 2200TapeStation、微量紫外可见光分光光度计进行基因组DNA扩增、定量、质量控制处理，MiSeq上机测序，生物信息学分析，获得菌群测序结果；

(3)分析评估

通过大数据健康评估系统，根据步骤(2)受检者菌群测序结果，比对标准健康数据库，确定该样本与健康人群、疾病人群的相似性，最终评估该样本受检者的健康情况，判断是否用药或就医处理。

作为改进，步骤(2)中基因组DNA提取时裂解温度设置为50-65℃，干燥温度设置为55-75℃。

作为改进，所述步骤(2)中质量控制合格的标准为相应片段大小位置出现一个清晰地主条带，条带峰值尖锐，峰图底部没有拖尾。

作为改进，步骤(2)中MiSeq上机测序处理时，选用Illumina v3试剂盒。

作为改进，根据步骤(3)获得的测量数据，与健康样本库中生殖道菌群进行比对，再与阴道炎患者的菌群种类进行比对，得出与上述患者菌群相似度分析报告及风险预测评估报告。

作为改进，根据步骤(3)获得的测量数据，依据风险预测评估报告，给出健康管理方案。

有益效果：本发明提供的高通量基因测序评估生殖道菌群健康的方法，通过整合和开发先进检测和诊断技术，获得精确的检测数据，同时，本发明基于检测装置的检测精确度高、标准数据库容量大，获得的数据对于健康评估的可靠性极好，同时在进行实际测量操作时，简单、快捷，这一测量方法将会引领健康产业的发展方向。

上述说明仅是本发明技术方案的概述，为了能够更清楚了解本发明的技术手段，并可依照说明书的内容予以实施，以下以本发明的较佳实施例并配合附图详细说明如后。

附图说明

图1为本发明基因组DNA提取示意图。