[发明专利]一种个体化用药相关基因多态性的检测方法

说明书

本发明提供了一种个体化用药相关基因多态性的检测方法，其特征在于，包括：预先合成SEQ ID NO.1～38所示的特异性扩增引物和SEQ ID NO.39～57所示的单碱基延伸引物，配置包含特异性扩增引物和DNA模板的PCR扩增体系；利用PCR仪对PCR扩增体系进行扩增反应，顺次进行消化处理，获得第二反应体系；配置包含单碱基延伸引物的单碱基延伸反应体系；向第二反应体系中加入单碱基延伸反应体系，并进行延伸反应，顺次进行脱盐纯化处理，获得纯化产物；利用包括有质谱仪的检测仪器检测纯化产物，确定待测样本的目标SNP位点的基因多态性。本方案能够提高个体化用药相关基因多态性的检测效率。

技术领域

本发明涉及生物检测技术领域，特别涉及一种个体化用药相关基因多态性的检测方法。

背景技术

精神科药物代谢与副作用相关的多个基因的特定SNP位点的多态性，在精神科针对不同类型患者合理使用精神药物具有重要指导意义。

目前，在对患者进行个体化精神科药物用药的基因多态性检测时，通常采用聚合酶链式反应PCR-直接测序法检测患者的个体化用药的基因多态性。

但是，采用PCR-直接测序法检测个体化用药基因多态性周期较长，从而导致个体化用药相关基因多态性的检测效率低。

发明内容

本发明实施例提供了一种个体化用药相关基因多态性的检测方法，能够提高个体化用药相关基因多态性的检测效率。

本发明实施例提供了一种个体化用药相关基因多态性的检测方法，包括：

预先合成LEPR基因、ANKK1基因、EPHX1基因、SCN1A基因、FKBP5基因、HTR1A基因、CYP2C9基因、MC4R基因、EPM2A基因、DRD2基因、UGT1A9基因、CYP1A2基因、CYP2C19基因的目标SNP位点的特异性扩增引物和单碱基延伸引物，其中，所述特异性扩增引物序列如SEQ IDNO.1～38所示，所述单碱基延伸引物序列如SEQ ID NO.39～57所示；

从待测样本中提取出待测样本基因组DNA，并将所述待测样本基因组DNA作为DNA模板；

配置包含所述特异性扩增引物和所述DNA模板的PCR扩增体系；

利用PCR仪对所述PCR扩增体系进行扩增反应，获得第一反应体系；

对所述第一反应体系进行消化处理，获得第二反应体系；

配置包含所述单碱基延伸引物的单碱基延伸反应体系；

向所述第二反应体系中加入所述单碱基延伸反应体系，并对加入所述单碱基延伸反应体系的所述第二反应体系进行延伸反应，获得第三反应体系；

对所述第三反应体系进行脱盐纯化处理，获得纯化产物；

利用包括有质谱仪的检测仪器检测所述纯化产物，确定所述待测样本的所述目标SNP位点的基因多态性。

优选地，

所述PCR扩增体系，包括：

蒸馏水8～10份，10*PCR buffer 4～6份，25mmol的MgCl₂ 3～5份，20mmol的脱氧核糖核苷三磷酸混合物1～2份，SEQ ID NO.1～38所示的特异性扩增引物的混合物9～11份、DNA聚合酶1～2份和DNA模板19～21份，其中，各组分按体积比计，9～11份的特异性扩增引物的混合物中的每种特异性扩增引物的浓度均为0.1～2μmol，1～2份的所述DNA聚合酶的浓度为0.5～2U/μl，19～21份的所述DNA模板的量为5～500ng。

优选地，

所述单碱基延伸反应体系，包括：