[发明专利]一种用于乳腺癌诊断及预后的标志物以及其获得方法

说明书

本发明提供一种用于乳腺癌诊断及预后的标志物以及其获得方法，该标志物为5′‑tiRNA^Val；该方法包括：(1)预测靶基因：通过基因本体功能富集分析、京都基因与基因组百科全书通路分析以及将各数据库进行交集比较找到交集基因；(2)靶基因筛选及验证：(21)通过分析判断得到前述交集基因存在互补结合5′‑tiRNA^Val种子区域的MER；(22)通过检测转染5′‑tiRNA^Val模拟物后两株细胞中基因的相对表达量，找到FZD3在两株细胞中显著降低；(23)通过荧光素酶报告基因检测，得到5′‑tiRNA^Val是与FZD3的3′‑UTR结合。本发明的标志物以及负向调控通路的作用机制迄今为止国内外未见报道，具有源头创新性，可为乳腺癌诊断和预后的新分子标志物提供理论实验依据。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，尤其是涉及一种用于乳腺癌诊断及预后的标志物以及其获得方法。

背景技术

乳腺癌是全球女性最常见的恶性肿瘤之一，发病率仅次于卵巢癌和宫颈癌。乳腺癌也是女性死于癌症的第二大原因，仅次于肺癌。目前分子生物学的进展对乳腺癌的早期诊断和治疗提供了很大的帮助，但对于晚期广泛侵袭和转移的乳腺癌的治疗仍然效果不佳，是乳腺癌患者死亡的主要原因。临床诊断乳腺癌的方法对于早期乳腺癌的发现敏感性很低，常用来诊断乳腺癌的血清标志物对早期诊断的敏感性和特异性均不理想。因此，深入理解乳腺癌的发生和发展机制，积极筛选鉴定有效的诊断和预后标志物，对提高乳腺癌检出率和治愈率具有重要意义。

发明内容

本发明的目的在于：针对现有技术存在的问题，提供一种用于乳腺癌诊断及预后的标志物以及其获得方法，解决常用来诊断乳腺癌的血清标志物对早期诊断的敏感性和特异性均不理想的问题。

本发明的发明目的通过以下技术方案来实现：

一种用于乳腺癌诊断及预后的标志物，该标志物为5′-tiRNA^Val(MINTbase数据库唯一ID:tRF-32-Q99P9P9NH57SJ)。

一种用于乳腺癌诊断及预后的标志物的获得方法，该方法包括：

(1)预测靶基因：通过基因本体功能富集分析、京都基因与基因组百科全书通路分析以及将GO(基因本体功能富集分析)、KEGG Pathway(京都基因与基因组百科全书通路分析)数据库进行交集比较找到交集基因；

(2)靶基因筛选及验证：

(21)通过分析判断得到前述交集基因存在互补结合5′-tiRNA^Val种子区域的MER(单体单元)；

(22)通过检测转染5′-tiRNA^Val模拟物后MDA-MB-231(乳腺癌细胞MDA-MB-231)和MCF-7(乳腺癌细胞MCF-7)两株细胞中基因的相对表达量，找到FZD3(卷曲蛋白家族受体3)在两株细胞中显著降低；

(23)通过荧光素酶报告基因检测，得到5′-tiRNA^Val是与FZD3(卷曲蛋白家族受体3)的3′-UTR(3’非翻译区)结合。