[发明专利]FA2H基因片段中与猪饲料转化相关的SNP遗传标记

说明书

本公开提供FA2H基因片段中与猪饲料转化相关的SNP遗传标记，通过鉴定了一个影响公猪饲料增重比的分子标记ASGA0092975，筛选出影响猪饲料增重比的大效应分子遗传标记，标记位于猪6号染色体12904530bp位置，且属于FA2H基因内含子序列，该位置为一个C>T突变，标记是有利于降低饲料增重比的等位基因；通过检测标记基因型辅助种猪选育，可通过选留TT纯合种猪进入核心群，降低饲料增重比，有效减少饲料消耗量和养殖成本；在杜长大商品猪群体中，具有ASGA0092975位点多态性的TT基因型猪的饲料增重比比CC基因型猪降低0.08，日均采食量降低了187.83g/天；所以，该SNP位点显著降低了家猪的饲料增重比，同时，验证了T是有利于降低饲料增重比和平均日采食量的等位基因。

技术领域

本公开涉及猪遗传基因技术领域，特别涉及FA2H基因片段中与猪饲料转化相关的SNP遗传标记。

背景技术

饲料效率作为一个重要的经济性状，一直受到国内外养猪企业和种猪改良公司的重点关注。20世纪中期，国内外沿用饲料增重比(Feed/Gain ratio,F/G)研究饲料效率，该性状为中等遗传力数量性状。2015年Mignon等(Mignon G S,rideau N,Gabriel I,etal.Detection of QTL controlling feed efficiency and excretion in chickens feda wheat-based diet.Genetics Selection Evolution,47(1):74(2015))在鸡中检测到了13个与饲料转化率有关的QTL。据报道，猪的细胞信号转导抑制因子2(Suppressor ofCytokine Signalling 2,CRADD)基因、黑皮质素受体4(Melanocortin 4 receptor,MC4R)基因存在与饲料转化率显著相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点。研究表明，FA2H基因(Fatty Acid 2-Hydroxylase)对羟基化脂肪酸的合成和功能具有特异性，有利于调节蛋白质转运和脂肪代谢(Li Y,Wang C,Huang Y，etal.C.Elegans Fatty Acid Two-Hydroxylase Regulates Intestinal Homeostasis byAffecting Heptadecenoic Acid Production.CELL PHYSIOL BIOCHEM,49:947-960(2018))。Guo等(Guo L,Zhang X,Zhou D Q,et al.Stereospecificity of fatty acid 2-hydroxylase and differential functions of 2-hydroxy fatty acidenantiomers.Journal of lipid research,53(7):1327-35(2012))表明，脂肪细胞中FA2H基因的敲除会降低葡萄糖的摄取和脂肪生成。

饲料转化率作为评价饲料利用效率的中等遗传力性状，有良好的选择反应。利用SNP标记辅助选育饲料利用效率相关性状对养猪生产管理和企业经济效益具有重要影响。①低饲料增重比猪的饲料利用效率高(Vigors S,Sweeney T,Oshea C J,et al.Pigs thatare divergent in feed efficiency,differ in intestinal enzyme and nutrienttransporter gene expression,nutrient digestibility and microbialactivity.Animal,10(11):1848-1855(2016))，能降低生产中的饲料使用量和生产成本，进而节约了饲料资源，亦能一定程度减少猪的排污量，从而减缓猪与人类竞争粮食资源和养猪业环保问题的压力。②开发有效的分子标记用于饲料效率相关性状选育工作，大大缩短培育周期，降低培育成本，提高选种准确度，加快遗传进展，能避免引种-退化-再引种的现象。