[发明专利]一种简易高效的肿瘤免疫治疗生物标志物及其用途

权利要求书

1.一种存储有计算机程序的计算机可读存储介质，所述计算机程序被执行时可以实现方法步骤，所述方法步骤包括：

根据式I计算获得肿瘤抗原呈递指数TAPS

TAPS = Average [(Log₂ APM_exp) – Average (Log₂ REF_exp)]           式I

其中，REF_exp表示内参基因的mRNA的表达数据，APM_exp表示抗原呈递基因的mRNA的表达数据；用于计算TAPS的内参基因选自VPS29、SNRPD3、PSMB2、VCP、RAB7A、PSMB4、C1or43、GAPDH、ACTB中的至少3个。

2.如权利要求1所述的计算机可读存储介质，其特征在于，样品来源于能够接受肿瘤免疫治疗的动物。

3.如权利要求2所述的计算机可读存储介质，其特征在于，样品来源于人类。

4.如权利要求2所述的计算机可读存储介质，其特征在于，所述肿瘤免疫治疗包括免疫检查点抑制剂治疗，更具体包括向个体施用抗PD-1抗体、PD-L1抗体、CTLA-4抗体中的一种或多种的治疗方法。

5.如权利要求1所述的计算机可读存储介质，其特征在于，样本选自肿瘤样本。

6.如权利要求5所述的计算机可读存储介质，其特征在于，所述肿瘤选自黑色素瘤、肺癌、尿路上皮癌、头颈癌、肾癌、淋巴瘤、前列腺癌、乳腺癌、神经胶质瘤、子宫颈癌、子宫内膜癌、食管癌、肝癌、间皮瘤、卵巢癌、胰腺癌、副神经节瘤、结肠癌、肉瘤、胃癌、睾丸生殖细胞肿瘤、甲状腺癌、或胸腺瘤。

7.如权利要求1所述的计算机可读存储介质，其特征在于，用于计算TAPS的抗原呈递基因选自PSMB8、PSMB9、PSMB10、TAP1、TAP2、CANX、CALR、PDIA3、TAPBP、B2M、HLA-A、HLA-B、HLA-C中的至少6个。

8.一种设备，包括：处理器及存储器；

所述存储器用于存储计算机程序，所述处理器用于执行所述存储器存储的计算机程序，以使所述设备执行方法步骤，所述方法步骤包括：

根据式I计算获得肿瘤抗原呈递指数

TAPS = Average [(Log₂ APM_exp) – Average (Log₂ REF_exp)]           式I

其中，REF_exp表示内参基因的mRNA的表达数据，APM_exp表示抗原呈递基因的mRNA的表达数据；用于计算TAPS的内参基因选自VPS29、SNRPD3、PSMB2、VCP、RAB7A、PSMB4、C1or43、GAPDH、ACTB中的至少3个。

9.一种装置，包括如权利要求1所述的计算机可读存储介质，所述装置可以包括：

TAPS处理模块，用于根据样本的抗原呈递基因mRNA的表达数据和内参基因mRNA的表达数据，根据式I计算获得TAPS；用于计算TAPS的内参基因选自VPS29、SNRPD3、PSMB2、VCP、RAB7A、PSMB4、C1or43、GAPDH、ACTB中的至少3个。