[发明专利]一种用于检测冠心病的基因芯片信息处理系统及方法有效
申请号: | 201910509676.6 | 申请日: | 2019-06-13 |
公开(公告)号: | CN110277137B | 公开(公告)日: | 2022-03-18 |
发明(设计)人: | 黄裕立;胡允兆;卢剑华;吕伟标;黎文生 | 申请(专利权)人: | 南方医科大学顺德医院(佛山市顺德区第一人民医院) |
主分类号: | G16B20/30 | 分类号: | G16B20/30;G16B30/10;G16B50/00 |
代理公司: | 深圳市广诺专利代理事务所(普通合伙) 44611 | 代理人: | 祝晶 |
地址: | 528300 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 冠心病 基因芯片 信息处理 系统 方法 | ||
1.一种用于检测冠心病的基因芯片信息处理方法,其特征在于,所述用于检测冠心病的基因芯片信息处理方法包括:
第一步,通过冠心病采集模块利用医疗设备采集患者冠心病表征参数;
第二步,中央控制模块通过杂交模块利用基因芯片与样本杂交获取待检测基因的信息;通过放射显影模块利用医疗放射设备对杂交后的基因芯片进行放射显影操作;通过荧光检测模块利用荧光检测器检测杂交后的基因芯片杂交结果;然后,通过数据分析模块利用分析程序根据检测数据对患者冠心病状态进行分析;
所述获取待检测基因的信息的方法包括以下步骤:
步骤一,通过基因获取模块获取待检测基因的序列数据;
步骤二,通过数据库建立模块将已知的融合基因断裂点以及断裂点前面的N个序列和断裂点后面的M个序列组成种子,种子的集合形成融合基因数据库;
步骤三,通过云服务模块集中大数据资源对融合基因数据进行处理;
步骤四,通过基因检测模块检测基因的序列信息;通过序列对比模块对比基因序列信息是否相同;具体包括:首先,获取待比对序列中预设长度子序列的索引值;
其次,根据所述索引值从参考基因序列中读取对应的比对序列;
然后,判断所述待比对序列和所述比对序列是否相同,得到判断结果;
最后,根据所述判断结果对所述待比对序列进行比对;
若所述判断结果为所述待比对序列和所述比对序列相同,则将所述索引值作为所述待比对序列的位置信息;
若所述判断结果为所述待比对序列和所述比对序列不同,则判定所述待比对序列中存在插入缺失;
步骤五,通过基因判断模块判断当包含待检测基因包含种子信息时,则认为待检测基因内含有融合基因;否则认为不包含融合基因;
第三步,通过显示模块利用显示器显示检测放射影像、杂交结果、脂蛋白信息;
所述用于检测冠心病的基因芯片信息处理方法的冠心病采集方法如下:
1)采集冠心病基因数据,建立冠心病易感基因数据库;在GWAS网站上初步查询到与冠心病相关联的基因名称;
在NCBI的Pubmed数据库里面,筛查出与中国人冠心病相关的易感基因;
查找与中国人群相关的关联分析的结果,确定所得到的易感基因的位点组合;
在NCBI的SNP数据库中验证上步中所确定的易感基因的位点;
编写易感基因文集;其中,所述易感基因文集包括基因信息、功能信息、致病信息、提示信息以及环境因素;
2)根据步骤1)所建立的冠心病易感基因数据库构建个体冠心病的表征参数分析平台;
3)基于步骤2)所建立的分析平台对个体的冠心病的表征参数进行分析;
4)输出个体的冠心病的表征参数。
2.一种基于权利要求1所述的用于检测冠心病的基因芯片信息处理方法的用于检测冠心病的基因芯片信息处理系统,其特征在于,所述用于检测冠心病的基因芯片信息处理系统包括:
冠心病采集模块,与中央控制模块连接,用于通过医疗设备采集患者冠心病表征参数;
中央控制模块,与冠心病采集模块、杂交模块、放射显影模块、荧光检测模块、数据分析模块、显示模块连接,用于通过单片机控制各个模块正常工作;
杂交模块,与中央控制模块连接,用于通过基因芯片与样本杂交获取待检测基因的信息;
放射显影模块,与中央控制模块连接,用于通过医疗放射设备对杂交后的基因芯片进行放射显影操作;
荧光检测模块,与中央控制模块连接,用于通过荧光检测器检测杂交后的基因芯片杂交结果;
数据分析模块,与中央控制模块连接,用于通过分析程序根据检测数据对患者冠心病状态进行分析;
显示模块,与中央控制模块连接,用于通过显示器显示检测放射影像、杂交结果信息。
3.一种应用权利要求1所述的用于检测冠心病的基因芯片信息处理方法的信息数据处理终端。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于南方医科大学顺德医院(佛山市顺德区第一人民医院),未经南方医科大学顺德医院(佛山市顺德区第一人民医院)许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201910509676.6/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。