[发明专利]一种中药化学成分命名实体识别方法与装置在审

专利信息
申请号: 201910512263.3 申请日: 2019-06-13
公开(公告)号: CN110223737A 公开(公告)日: 2019-09-10
发明(设计)人: 刘勇国;蒋羽;李杨;何家欢;蔡茁;杨尚明;李巧勤 申请(专利权)人: 电子科技大学
主分类号: G16C20/70 分类号: G16C20/70
代理公司: 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 代理人: 马超前
地址: 610054 *** 国省代码: 四川;51
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摘要:
搜索关键词: 命名实体 中药化学 语料库 标注 基础数据库 成分识别 技术应用 人工识别 神经网络 数据来源 文本内容 信息过滤 训练样本 构建 规范化
【说明书】:

发明提供一种中药化学成分命名实体识别方法与装置,包括以下步骤:S1:获取中药化学成分命名实体相关文献;S2:对获取的所述相关文献进行信息过滤,以得到文本内容规范化的语料库;S3:对所述语料库进行编码和标注,得到标注好的语料库;S4:将所述标注好的语料库作为BiLSTM的训练样本进行训练,得到训练好的BiLSTM;S5:将需要识别中药化学成分命名实体的相关文献输入所述训练好的BiLSTM进行识别,以识别出中药化学成分命名实体。本发明方法将基于深度神经网络的命名实体识别技术应用到中药化学成分识别,比人工识别方式有更高的效率;有利于为构建中药化学成分命名实体基础数据库提供数据来源。

技术领域

本发明涉及信息处理技术领域,尤其涉及一种基于深度神经网络的中药化学成分命名实体识别方法与装置。

背景技术

中药化学成分命名实体,是指中药所含化学成分的名称,如甘草香豆素、杠柳毒苷元、二氢咖啡酸、大黄素甲醚-8-O-β-D-葡萄糖苷等,是对不同成分使用不同名称加以区别和称呼、并遵循一定规则的命名方式。

目前现有中药化学成分命名实体研究比较零散,没有标准的中药化学成分命名实体数据库,为帮助中药研究人员快速、高效地获取最新的中药化成分研究进展,迫切需要对中药化学成分命名实体进行整理,从大量零散的研究文献中有效识别中药化学成分命名实体。

随着自然语言处理技术的发展,基于自然语言处理的命名实体识别技术已经开始用于生物医学文献中的西药化学成分识别,常用的方法有模式匹配、机器学习以及深度神经网络的方法,或者将多种方法进行融合。西药的化学药物名称在命名上严格遵循化合物的命名规则,具有规范性。与西药的化学成分名称相比,中药的天然药物成分名称在命名方式上存在差别。比如,天然药物成分名称有很多包含特殊的前缀、后缀,或者根据其来源的植物名称进行演化的命名,有的天然药物成分甚至使用俗名命名。因此,命名实体识别技术在中药化学成分识别领域仍是一片空白。目前对中药化学成分的整理工作还是通过人工方式,效率低,不利于推进标准中药化学成分命名实体数据库的建立。

发明内容

本发明的目的在于解决上述现有技术存在的缺陷,提供一种基于深度神经网络的中药化学成分命名实体识别方法与系统,解决命名不规范的中药化学成分命名识别问题。

一种中药化学成分命名实体识别方法,包括以下步骤:

S1:获取中药化学成分命名实体相关文献;

S2:对获取的所述相关文献进行信息过滤,以得到文本内容规范化的语料库;

S3:对所述语料库进行编码和标注,得到标注好的语料库;

S4:将所述标注好的语料库作为BiLSTM的训练样本进行训练,得到训练好的BiLSTM;

S5:将需要识别中药化学成分命名实体的相关文献输入所述训练好的BiLSTM进行识别,以识别出中药化学成分命名实体。

进一步地,如上所述的中药化学成分命名实体识别方法,所述S1包括:

S11:利用关键词从中文期刊文献数据库进行文献检索,并以PDF格式下载文献;以及从百度百科进行检索,使用网页爬虫的方法将得到的信息保存成TXT文本,以获取中药化学成分命名实体文档集;

S12:根据所述文档集提取文档内容。

进一步地,如上所述的中药化学成分命名实体识别方法,所述S3包括:

按照一定的规则对所述语料库进行编码,得到编码语料库;

对所述编码语料库按照一定的规则进行标注,以区分出中药化学成分命名实体和非中药化学成分命名实体,从而得到标注好的语料库。

进一步地,如上所述的中药化学成分命名实体识别方法,所述规则按照以下方法形成:

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