[发明专利]基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法及小分子靶标核酸适配体

权利要求书

1.一种基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法，其特征在于，包括：

步骤一，对小分子靶标进行结构分析；

步骤二，根据匹配原则，在小分子化合物库中对小分子靶标进行筛选；

判断所述小分子靶标是否符合所述匹配原则；

如果所述小分子靶标符合所述匹配原则，则所述小分子靶标作为目标小分子靶标；

如果所述小分子靶标不符合所述匹配原则，则根据小分子靶标结构式进行分子结构构建，将分子结构构建后的小分子靶标作为目标小分子靶标；

步骤三，所述目标小分子靶标在核酸分子数据库中与核酸分子进行分子对接，判断所述目标小分子靶标与所述核酸分子是否对接成功：

如果对接成功，则所述核酸分子为初选核酸适配体；

如果对接不成功，则重复步骤三。

2.根据权利要求1所述的基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法，其特征在于，步骤二中所述匹配原则为所述小分子靶标为不同基团组成的分子、含相同基团的同类分子、基团相同空间结构不同的手性分子及离子。

3.根据权利要求2所述的基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法，其特征在于，根据不同类型的小分子靶标选择不同的结合模式、结合参数或结合结构特征在核酸分子数据库中与核酸分子进行分子对接。

4.根据权利要求3所述的基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法，其特征在于，所述结合模式主要指小分子靶标与核酸适配体的空间结构匹配度。

5.根据权利要求1所述的基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法，其特征在于，所述小分子化合物库为ZING数据库。

6.根据权利要求1所述的基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法，其特征在于，利用检索加速引擎在小分子化合物库中对小分子靶标进行筛选；利用检索加速引擎使得所述目标小分子靶标在核酸分子数据库中与核酸分子进行分子对接。

7.一种小分子靶标核酸适配体，其特征在于，所述小分子靶标核酸适配体采用根据权利要求1-6项中任一项所述的基于高性能计算平台的小分子靶标核酸适配体计算机辅助筛选方法制备获得。