[发明专利]一种可实用于大规模鸽子性别鉴定的基因识别优化方法在审
申请号: | 201910524003.8 | 申请日: | 2019-06-17 |
公开(公告)号: | CN112094887A | 公开(公告)日: | 2020-12-18 |
发明(设计)人: | 不公告发明人 | 申请(专利权)人: | 南京尧顺禹生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 211812 江苏省南京市浦口区永宁*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 实用 大规模 鸽子 性别 鉴定 基因 识别 优化 方法 | ||
1.一种可实用于大规模鸽子性别鉴定的基因识别方法,其特征在于采集受检鸽的静脉血样、血样的前处理、处理后样品的再编号规范、处理后样品基因组DNA模板的制备、和制备的模板直接用于PCR的直接扩增。
2.如权利要求1所述的特征,受检鸽的血样采集的是静脉血,采集量为1-20μl,优选1μl。
3.如权利要求1所述的特征,将采集的血液转移至内装有10-100μl溶液A的1.5ml小塑料离心管中。优选20μl。以记号笔在塑料离心管盖上书写血样对应鸽子的唯一编号。优选以两位阿拉伯数字编号(00至96);每96个样品为一盒或一袋;每盒或每袋另行编号,优选以英文26个字母编号。血样的前处理是将1.5ml塑料管插入到塑料泡沫垫上,然后转移至沸水中孵育。沸水的温度为90℃以上,优选95℃;孵育时间为5-15分钟,优选10分钟。热处理后的样品迅速转移至冰上保存。
4.如权利要求3所述的特征,溶液A的成分是低渗液,其盐离子(氯化纳)含量范围是0至0.1%。
5.如权利要求3所述的特征,经预处理的样品在用作模板前将快速离心,以便将样品集中至EP管底部(此时EP管底部可见黑或紫色沉淀)。
6.如权利要求1所述的特征,处理后样品的再编号规范是通过优先编号未来用于PCR扩增的PCR管顺序来间接实现的。具体地,先以一个8联PCR管为一行顺序进行排列,以12行为一组(共96个样)。每一行确认从左到右的方向,对应的列依次(自左向右)编号为A、B、C、D、E、F、G、H(共8列)。12行确认从上到下的方向,行的编号(自上而下)顺序为1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12(共12行)。8联管每管的编号即将作为未来样品的编号方式。
7.如权利要求6所述的特征,将所有已编号的PCR管中分别加入0.5-2.0μl的一步法溶液(南京尧顺禹生物科技公司产品)(优选1.5μl),然后将经快速离心至管底的黑或紫色沉淀(如权利要求5所述)挑选部分转移至已编号且已加入1.5μl的一步法溶液(南京尧顺禹生物科技公司产品)的8联管中,对应的待性别鉴定的鸽子样品按8联管的编号进行排列,以8联管的编号作为待鉴定鸽子的新编号。
8.如权利要求1所述的特征,处理后样品基因组DNA模板的制备方法是将权利要求7所获得的样品盖上PCR管盖后快速离心,然后将PCR管按序转移至PCR仪中,按孵育、变性、和保存的程序进行处理。其中孵育温度是50-65℃,优选65℃;孵育时间是10-45分种,优选30分钟;变性温度是85-100℃;优选95℃;变性时间是2-30分钟,优选5分钟;保存温度是4-16℃,优选16℃。保存时间为1分钟-12小时,优选1分钟。
9.如权利要求1所述的特征,PCR直接扩增的方法是将按常规方法准备的PCR反应液(含1×PCR Mastermix和扩增引物各0.25μM(正向引物的序列为gatccagtgcttgtttcc和反向引物序列aacgtggcaacagagtac)9.5μl直接加入到如权利要求8所制备的鸽样基因组DNA模板溶液内。然后直接进行PCR反应。反应条件为:95℃ 2min;30×(95℃ 30s,56℃ 30s,72℃40s);72℃ 10min;16℃储存。
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