[发明专利]一种检测单碱基突变的方法及应用在审
申请号: | 201910536623.3 | 申请日: | 2019-06-20 |
公开(公告)号: | CN110272983A | 公开(公告)日: | 2019-09-24 |
发明(设计)人: | 杨国华;李婷;王晓欣;王磊 | 申请(专利权)人: | 武汉百翼生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/6806;C12Q1/6886;C12Q1/6883 |
代理公司: | 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 | 代理人: | 冯子玲 |
地址: | 430000 湖北省武汉市东湖开发区高新大道*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 单碱基突变 种检测 基因检测技术 药物不良反应 药物毒副反应 家族性疾病 基因检测 基因诊断 滥用药物 致病基因 检测 扩增 预测 治疗 应用 分析 制定 | ||
1.一种检测单碱基突变的方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1、DNA的提取:提取少量的动物或植物组织,放入杀菌消毒后的试管中,向试管中加入裂解溶液,将试管放置在高速离心机上离心,时间控制在5-10分钟;
S2、DNA的分离;
S3、DNA的纯化:在S2完成后,向试管内加入60%-70%的乙醇溶液以及浓度为10%-20%的TE溶液,并将试管放置在高速离心机内,高速离心3-5分钟,取试管内的下层溶液;
S4、DNA的分析;
S5、NDA的扩增:在DNA的试液中加入CRS引物,经过PCR扩增之后,其中“GCCG”为Hhal的酶切识别位点,从而使用CRS-PCR引物扩增等位基因时,在PCR的产物中就能够就形成了可由Hhal识别的酶切位点,酶切后每个等位基因的片段长度均不相等;
S6、DNA的检测:具体包括如下步骤:
M1、双链DNA分子采用聚丙烯酰胺凝胶电泳,其由于迁移行为决定于其分子大小和电荷,不同长度的DNA片段能够在聚丙烯酰胺凝胶基础上被区分开;
M2、加入了尿素和甲酰胺的混合溶液组成的变性剂梯度,从而能够把同样长度但序列不同的DNA片段区分开来一个特定的DNA片段有其特有的序列组成,其序列组成决定了其解链区域和解链行为一个几百个碱基对的DNA片段一般有几个解链区域,每个解链区域有一段连续的碱基对组成;
M3、当变性剂浓度逐渐增加达到其最低的解链区域浓度,该区域这一段连续的碱基对发生解链,浓度再升高依次达到各其他解链区域浓度时,这些区域也依次发生解链,直到变性剂浓度达到最高的解链区域浓度后,最高的解链区域也发生解链,从而双链DNA完全解链从而双链DNA完全解链;
M4、不同DNA片段的序列差异发生在最高的解链区域时,这些片段就不能被区分开来,从而双链DNA完全解链,如果不同DNA片段的序列差异发生在最高的解链区域时,这些片段就不能被区分开来,DNA片段中每个碱基处的序列差异都能被区分开;
2.根据权利要求1所述的一种检测单碱基突变的方法,其特征在于,所述DNA的分析具体包括如下步骤:
1)、取DNA原液15μl稀释至3.0ml,用UV-1601型紫外分光光度计测定230nm、260nm以及280nm的吸光值,高质量的DNA的要求:A260/A230小于2.0;同时A260/A280介于1.7到1.9之间;
2)、将DNA原适液适当稀释后,用1XTAE,0.8%琼脂糖凝胶2V/cm电泳1小时进行质量监测;
3)、向一定量的原适液的DNA中加入限制性内切酶EcoR1至4-5U/μg的DNA,在温度37摄氏度的状态下保存24小时,用0.5 XTBE,0.8%琼脂糖凝胶2.5V/cm电泳3小时进行检测。
3.根据权利要求1所述的一种检测单碱基突变的方法,其特征在于,所述S1中DNA提取时加入的裂解溶液具体为0.1mol/L氯化钠溶液、10mol/L的Tris-HCI溶液以及1%SDS溶液。
4.根据权利要求1所述的一种检测单碱基突变的方法,其特征在于,所述S1中DNA提取时加入的裂解溶液的PH为8.0。
5.根据权利要求1所述的一种检测单碱基突变的方法,其特征在于,所述S2中的DNA的分离具体包括向在完成操作S1后,向试管内加入苯酚-氯仿溶液、氯仿-异戊醇溶液、冰无水乙醇以及5mol/L的氯化钠溶液,并将试管再次放置在高速离心机上进行离心,当试管内的溶液出现白色絮状沉淀时,停止离心。
6.一种根据权利要求1-5所述的一种检测单碱基突变的方法的用途,其特征在于,具体的用途如下:
F1、了解自身是否有家族性疾病的致病基因,预测患病风险:资料证实10%~15%的癌症与遗传有关,糖尿病、心脑血管疾病等多种疾病都与遗传因素有关;
F2、用于疾病的诊断:采用基因诊断的方法,不仅敏感性大大提高,而且在短时间内就能得到结果;
F3、正确选择药物,避免滥用药物和药物不良反应:根据基因检测的结果,可制定特定的治疗方案,从而科学地指导使用药物,避免药物毒副反应。
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