[发明专利]一种细胞分层图像处理方法及系统有效
申请号: | 201910584542.0 | 申请日: | 2019-07-01 |
公开(公告)号: | CN110363719B | 公开(公告)日: | 2021-07-27 |
发明(设计)人: | 刘琴;张锴;宋志兵 | 申请(专利权)人: | 湖南开启时代智能科技有限公司 |
主分类号: | G06T5/00 | 分类号: | G06T5/00;G06T5/30;G06T7/13;G06T7/136 |
代理公司: | 长沙国科天河知识产权代理有限公司 43225 | 代理人: | 邱轶 |
地址: | 410000 湖南省长沙市高新开发区*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 细胞 分层 图像 处理 方法 系统 | ||
1.一种细胞分层图像处理方法,其特征在于,包括以下步骤:
从采集的细胞分层图像中提取感兴趣区域并去噪;
对去噪后图像的局部信息增强以增大整个图像对比度;
通过均值漂移算法对增强图像进行图像平滑处理和图像分割处理;
通过泛洪填充算法对分割的图像进行填充,获得粗分界区;
对填充后的图像进行灰度化处理并进行边缘检测,获得分割边界;
将分割边界所在区域填充完整并进行闭运算,获得完整的边界;
提取边界轮廓并在所述轮廓内绘制边界线,获得细胞分层图像;
所述通过均值漂移算法对增强图像进行色彩平滑处理获得不同色彩区域的步骤包括:
以增强图像为原图进行降采样构建图像金字塔;
从图像金字塔顶层图像开始,执行均值漂移迭代计算;
将上层均值漂移迭代计算的结果作为下一层金字塔计算的初值和mask;
根据上一层得到的初值和mask,得到下一层金字塔图像,将mask为1的所有像素进行均值漂移迭代,把迭代结果获得的质心位置平均值存储到mask为1的位置的对应像素中;
重复前述相邻两个步骤,直到达到金字塔塔底,遍历完成所有金字塔层的均值漂移色彩滤波,最终输出和原图一样分辨率大小的结果图;
所述从图像金字塔顶层图像开始,执行均值漂移迭代计算的步骤包括:
从金字塔顶层图像左上角第一个坐标像素点开始,以该点为中心点,其位置为(x0,y0)及颜色值为(b0,g0,r0),生成预定大小的二维方形窗口,并计算窗口中满足颜色相近条件的所有点的平均位置,作为质心(x1,y1),且颜色值为(b1,g1,r1);颜色相近条件采用下式距离计算:
Distance=(b0-bi)×(b0-bi)+(g0-gi)×(g0-gi)+(r0-ri)×(r0-ri)≤thresh
在上式中,(bi,gi,ri)为该方形窗口中每个像素的BGR值,thresh为阈值;
将窗口中心平移到(i)获取的质心位置(x1,y1),计算以该质心为中心生成预定大小的新的二维方形窗口中满足颜色相近条件的所有点的质心平均位置及颜色平均值,以更新(x0,y0)和(b0,g0,r0);
重复迭代执行前一更新步骤,直到新位置的质心位置和颜色平均值与上一次的中心点的位置差值和颜色差值满足迭代精度的条件,则将迭代结束获取的质心值的BGR值赋给对应的中心点作为该点的新像素值;
所述提取边界轮廓并在所述轮廓内绘制边界线,获得细胞分层图像的步骤包括:
提取所有完整的边界轮廓;
获取每个轮廓的最小外接矩形;
删除高度小于或等于阈值的轮廓,保留高度大于阈值的轮廓形成有效边缘轮廓;
根据最小外接矩形提取每个有效边缘轮廓的中心线,获得图像分层的边界线。
2.如权利要求1所述的细胞分层图像处理方法,其特征在于,所述从采集的细胞分层图像中提取感兴趣区域并去噪的步骤包括:
提取细胞分层图像中各分层覆盖的区域作为感兴趣区域;
以感兴趣区域图像作为提取矩阵通过双边滤波算法进行去噪。
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