[发明专利]用于检测ddcfDNA的产品在制备检测肺部感染引起的移植肾损伤和预后中的用途在审
申请号: | 201910587416.0 | 申请日: | 2019-06-28 |
公开(公告)号: | CN110452975A | 公开(公告)日: | 2019-11-15 |
发明(设计)人: | 蒋廷亚;刘海涛;葛军;刘枫;王啸晨;黎小锋 | 申请(专利权)人: | 上海奥根诊断技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C40B50/06;C12Q1/6869 |
代理公司: | 11250 北京三聚阳光知识产权代理有限公司 | 代理人: | 谢楠<国际申请>=<国际公布>=<进入国 |
地址: | 201100上海市闵*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肺部感染 检测 肾损伤 预后效果 移植 预后 供体 评估 游离 移植肾功能 早期诊断 器官移植 灵敏度 肾移植 术后 无创 血浆 制备 损伤 诊断 痛苦 | ||
1.一种用于检测ddcfDNA的产品在制备检测肺部感染引起的移植肾损伤的产品中的用途。
2.根据权利要求1所述的用途,其特征在于,所述的用途还包括制备评估肺部感染引起的移植肾损伤预后的产品中的用途。
3.根据权利要求1或2所述的用途,其特征在于,所述的用于检测ddcfDNA的产品包括检测ddcfDNA的SNP分子标记、检测SNP分子标记的探针、ddcfDNA的检测芯片、ddcfDNA的检测试剂盒或ddcfDNA的检测装置。
4.根据权利要求3所述的用途,其特征在于,所述检测ddcfDNA的SNP分子标记选自如表1中所示的SNP位点;优选的,所述SNP位点包括药物代谢基因的SNP位点;优选的,所述药物代谢基因为CYP3A4、CYP3A5和CYP2D6;优选的,所述检测SNP分子标记的探针是基于所述SNP位点设计而成的;优选的,所述探针包括上游探针和下游探针,所述上游探针的序列是以所述SNP位点为坐标起点,向5’方向延伸80bp的碱基序列为序列信息设计的;所述下游探针的序列是以所述SNP位点为坐标起点,向3’方向延伸80bp碱基序列为序列信息设计的。
5.根据权利要求3或4所述的用途,其特征在于,所述ddcfDNA的检测芯片包括所述检测SNP分子标记的探针;优选的,还包括单分子标记接头,所述单分子标记接头是由正向序列和反向序列部分配对后的Y型接头;优选的,所述正向序列由5’端至3’端依次包括5’-接头和特异性分子标签A,所述反向序列由3’端至5’端依次包括3’-接头和特异性分子标签B;优选的,所述5’-接头的碱基序列如SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2所示,所述3’-接头的碱基序列如SEQ ID NO.3或SEQ ID NO.4所示,所述特异性分子标签A的碱基序列如SEQ ID NO.5所示,所述特异性分子标签B的碱基序列如SEQ ID NO.10所示,其中N代表随机碱基;优选的,所述正向序列的3’末端连接有碱基T,所述反向序列的5’末端连接有磷酸基团;优选的,所述正向序列如SEQ ID NO.6或SEQ ID NO.7所示,所述反向序列如SEQ ID NO.8或SEQ IDNO.9所示;优选的,还包括试剂盒,所述试剂盒包括检测ddcfDNA的SNP分子标记、检测SNP分子标记的探针、ddcfDNA的检测芯片或单分子标记接头。
6.根据权利要求3或4或5所述的用途,其特征在于,还包括所述ddcfDNA的检测装置,所述检测装置包括:(1)样本获取单元,用以获取基因组DNA和血浆cfDNA;(2)ddcfDNA定量单元,检测ddcfDNA,以获取ddcfDNA定量结果;(3)质控单元,对上述样本获取单元和ddcfDNA定量单元进行监测调控。
7.根据权利要求1-3任一项所述的用途,其特征在于,所述检测肺部感染引起的移植肾损伤或预后的产品包括用于检测肺部感染引起的移植肾损伤或预后的SNP分子标记、探针、检测芯片、试剂盒或检测装置。
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