[发明专利]一种与狮头鹅头围相关的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种狮头鹅头围相关的分子标记及其应用。所述分子标记为鹅RAP1A基因DNA序列GenBank登录号为XM_013189666中第1545bp处的C/G碱基突变。通过对上述C/G突变位点的检测，可以确定目标鹅群头围大小这一性状的基因型，也可以通过基因型判别某一个体的头围是大头围还是小头围，为有目的地对鹅群头围性状进行选择提供依据，提高后代鹅头围的大小。以该分子标记建立的选育头大颈粗狮头鹅新品系的方法周期短、速度快、准确率高。

技术领域

本发明属于分子标记辅助育种技术领域，更具体地，涉及一种与狮头鹅头围相关的分子标记及其应用。

背景技术

我国鹅的总饲养量占全世界的90％以上，据统计，2016年全国鹅出栏量达到5.18亿只，其中，广东省鹅出栏量为2.57亿只，数量位居全国第二。狮头鹅是广东省特色的农业家禽品种，也是世界上最大型的鹅种之一，主要养殖于澄海、潮安县、汕头郊区等地。狮头鹅具有生长速度快、体型大、产肉多、狮头鹅肝肥美、抗逆性强、适应性强、抗逆性强等优点。大头围是狮头鹅的重要经济指标之一，大头围鹅一般体型硕大，产肉量高，鹅肝质量优异，并且头大颈粗也是选育种鹅的筛选标准和市场需求。

长期以来，狮头鹅长期采用闭锁繁育等技术，育种工作相对滞后，种狮头鹅头颈、体型大小不均，个体生产性能差异大，缺乏良繁体系，缺乏现代化育种技术，传统育种技术效率低、成本高，缺乏有效的狮头鹅表型性状分析检测技术和设备，缺乏对狮头鹅基因组的研究，对重要育种基因或标记的发掘未有开展。

综合以上原因导致狮头鹅品种性能差，良种覆盖率低，这一系列问题严重阻碍了狮头鹅产业的发展。

发明内容

本发明针对于以上问题，，对头围有显著差异的狮头鹅进行全基因组关联分析(GWAS)，挖掘与狮头鹅头围性状相关的主要候选基因，并逐一进行表型的相关验证，找到了所述与鹅头围相关的分子标记，并且利用该分子标记提供了一种快速筛选大头围狮头鹅的方法，也指出了该分子标记在狮头鹅选育方面和筛选大头围狮头鹅试剂盒方面的应用。

为了实现上述目的，本发明是通过以下技术方案予以实现的：

提供一种与狮头鹅头围大小相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记为所述分子标记为鹅RAP1A基因DNA序列GenBank登录号为XM_013189666中第1545bp处的C/G碱基突变。

进一步，所述第1545bp处核苷酸为C，即基因型为C/C时，该鹅为大头围，，所述大头围为≥25cm。

狮头鹅以头似狮头二得名，大头围是其重要的经济特征之一，但实际生产中狮头鹅头围大小不均，整齐度差。头围还是挑选优种狮头鹅的市场标准之一，头围大的鹅一般体型也较大，抗病能力强，然而传统育种筛选的大头围狮头鹅种鹅的大头围性状遗传稳定性差，子代头围差异性较大，需要多世代反复筛选，育种时间长，而且耗费人力财力，所以如何通过能够遗传的分子标记更精准的选育大头围鹅种，且在幼鹅早期快速判断头围生长趋势，是生产中亟待解决的问题。

发明人首次发现RAP1A基因第1545bp处的碱基为C/G碱基突变是影响鹅头围大小的分子标记，且当该位点基因型是纯合C/C时，头围显著大于纯合G/G。

本发明也保护一种所述分子标记在制备筛选大头围狮头鹅检测试剂盒中的应用。

本领域技术人员很容易根据本发明所提供的分子标记设计出用于扩增该分子标记的引物和/或探针，用于检测狮头鹅以此标记为依据的基因型，从而判断狮头鹅头围的大小。

本发明同时保护一种权利要求1或2所述分子标记在狮头鹅育种中的应用。

利用本发明所提供的分子标记能够在短时间内确定狮头鹅与头围相关的基因型，从而为选育大头围这一重要经济性状提供理论基础，也为选育工作节省了成本、人力和时间。