[发明专利]湖羊MC4R基因的分子标记SNP732及其应用

说明书

本发明涉及分子标记领域，具体地涉及湖羊MC4R基因的分子标记SNP732及其应用，本发明公开了一种湖羊MC4R基因的SNP分子标记、相关引物对、试剂盒，以及它们在湖羊分子标记辅助育种中的应用，进一步涉及一种筛选湖羊体尺性状的方法及其在湖羊分子标记辅助育种中的应用。

技术领域

本发明涉及分子标记领域，具体地涉及一种湖羊MC4R基因的SNP分子标记、相关引物对、试剂盒，以及它们在湖羊分子标记辅助育种中的应用，进一步涉及一种筛选湖羊体尺性状的方法及其在湖羊分子标记辅助育种中的应用。

背景技术

黑素皮质素受体-4(Melanocortinreceptor-4，MC4R)是下丘脑腹内侧核分泌的一类肽类物质，参与体重以及能量平衡的调节，由中枢神经系统中的多个神经元群体表达。与MCR家族其它成员不同的是，MC4R不存在于肾上腺皮质、毛囊及胎盘内，而是大量存在于中枢神经系统的各个区域中，包括大脑皮质、丘脑、下丘脑、脑干和脊索。人、猪、牛、羊、犬等哺乳动物的MC4R由332个氨基酸残基组成，具有7次跨膜结构，是跨膜G蛋白耦联受体家族的成员之一。

瘦素和胰岛素是动物摄食调控最重要的外周调节因子，MC4R可作为瘦素、胰岛素摄食调控通路的下游介质，实现对动物摄食的调控。因而该蛋白在中枢神经系统调节葡萄糖稳态过程中发挥着重要作用。哺乳动物MC4R基因的突变将破坏中枢神经系统内的肾上腺皮质通路，增加食欲和减少饱腹感，间接造成肥胖。人、犬、猪、牛、羊等哺乳动物MC4R基因的突变研究均显示，该基因可作为哺乳动物体重或生长性状的候选功能基因，在基因内存在很多与动物生长性状关联的SNPs。根据MC4R基因突变引起的表型效应，可以将该基因的突变分为五种类型：①引起MC4R蛋白质合成缺陷，或加速其降解，表现为MC4R蛋白量显著降低；②引发蛋白折叠或胞内转运的错误，导致蛋白滞留于细胞内；③虽然蛋白可正确整合于细胞膜，但与配体的结合能力下降；④引发信号传导障碍；⑤突变导致的效应尚不明确。

MC4R基因作为哺乳动物经典的生长性状候选基因，其SNP研究受到了广泛关注，并在多物种中得到了可用于后续选育的候选功能性SNPs。因此，利用家畜群体内的MC4R基因SNP对家畜体重、体尺的影响，在该基因内筛选出有利于湖羊体重增长、生长增速及肥育、屠宰性状的SNP，并对有利于增加体重和肉质评分的基因型个体进行有目的的选种选配，将有助于培育出生长速度快，胴体品质好的湖羊群体，提高经济效益。

发明内容

本发明以湖羊肉用新类群第三世代核心群的202头雌性个体为研究对象，采取PCR及产物直接测序的方式，确定湖羊肉用新类群第三世代核心群MC4R基因的SNPs，并与个体的生长性状进行关联分析，筛选与湖羊生长性状关联的SNPs，为湖羊肉用系分子育种提供有用方法。

为此，本发明的一个目的是提供一种与湖羊体尺性状相关的SNP分子标记，其特征在于与SEQ ID NO:1比对，该分子标记包括位于相应于SEQ ID NO:1的第706位的SNP706，其为C或A。优选，其中所述分子标记的序列如SEQ ID NO:1所示，所述第706位为C或A。

本发明的另一个目的是提供一种与湖羊体尺性状相关的SNP分子标记，其特征在于与SEQ ID NO:1比对，该分子标记包括位于相应于SEQ ID NO:1的第732位的SNP732，其为C或G。优选，其中所述分子标记的序列如SEQ ID NO:1所示，所述第732位为C或G。

本发明的另一个目的是提供一种用于检测上述的SNP706或SNP732的引物对。优选其序列如SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示。

本发明的另一个目的是提供包含上述引物对的试剂盒。

本发明的另一个目的是提供上述的SNP分子标记、引物对或试剂盒在筛选湖羊体尺性状或湖羊分子标记辅助育种中的应用。