[发明专利]一种基于二代测序技术的游离线粒体DNA突变检测技术在审

专利信息
申请号: 201910616177.7 申请日: 2019-07-09
公开(公告)号: CN110305945A 公开(公告)日: 2019-10-08
发明(设计)人: 邢金良;刘洋;尹纯 申请(专利权)人: 中国人民解放军第四军医大学
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;G16B30/10
代理公司: 北京盛凡智荣知识产权代理有限公司 11616 代理人: 梁永昌
地址: 710032 陕西*** 国省代码: 陕西;61
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摘要:
搜索关键词: 游离 线粒体DNA突变 二代测序技术 检测技术 突变检测 测序文库 数据分析 突变频率 假阳性 片段化 单链 富集 制备 捕获 检测
【权利要求书】:

1.一种基于二代测序技术的游离线粒体DNA突变检测技术,其特征在于:主要包括以下步骤:

1)制备cfDNA单链测序文库:将提取的cfDNA片段末端去磷酸化并变性为单链;利用DNA连接酶在cfDNA片段的两侧末端连接接头,接头含有12bp的随机碱基序列;通过引物延伸,将单链DNA文库变成双链文库。

2)mtDNA捕获:利用三对引物扩增mtDNA片段,并将PCR产物等摩尔混合后打断到150bp,制备生物素标记的杂交捕获探针;按照探针与模板800:1摩尔比的含量进行捕获并测序。

3)数据分析:对测序数据进行质控,利用BWA-mem软件将质控后的clean data比对至人类参考基因组hg19上,最后提取比对到线粒体参考基因组rCRS的数据进行突变位点分析。

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