[发明专利]一种高效土壤微生物总RNA提取方法有效
申请号: | 201910619713.9 | 申请日: | 2019-07-10 |
公开(公告)号: | CN112175941B | 公开(公告)日: | 2023-07-07 |
发明(设计)人: | 李祥楷;裴亚欣 | 申请(专利权)人: | 兰州大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 兰州锦科标联知识产权代理事务所(普通合伙) 62203 | 代理人: | 王园园 |
地址: | 730000 甘肃*** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 高效 土壤 微生物 rna 提取 方法 | ||
1.一种高效土壤微生物总RNA提取方法,其特征在于,其步骤如下:
步骤1:选择4g新鲜土样,加入2.5mL Bead Solution,再加入0.5mL SR1和1.6mLSR2,加入5mL 酚/氯仿/异戊醇,5mL 酚/氯仿/异戊醇的pH值为6.5-8.0;所述的SR1 溶液为含有SDS 以及其它用于细胞裂解的试剂;所述的SR2 溶液为沉淀溶液,去除腐殖质、细胞碎片及蛋白质非 DNA 的有机、无机成分,有机及无机成分的污染会影响到最终 RNA 的质量并抑制下游RNA 实验;
步骤2:将步骤1中的样品放置到旋涡搅拌器中,最大转速涡旋振荡20min;
步骤3:将步骤2中的样品在4℃下、2500g的离心力下离心分离15min,保留取出上层清液;
步骤4:将步骤3中的样品中加入2mL SR3,混合均匀后在4℃下孵育10min;所述的SR3溶液为沉淀溶液,沉淀蛋白质和细胞碎片;
步骤5:将步骤4中的样品在4℃、2500g的离心力下离心分离15min,保留取出上层清液;
步骤6:将步骤5中的样品加入6mL混合液后混合均匀,混合液为1:1的SR4和SR6,在4℃下孵育30min;所述的SR4为100%异戊醇,所述的SR6为盐溶液;
步骤7:将步骤6中的样品在4℃、2500g的离心力下离心分离30min,丢弃上层清液;
步骤8:将步骤7中的样品的中下层溶液倒立放置在滤纸上,干燥5min;
步骤9:将步骤8中的样品加入1mL的SR5溶液,悬起沉淀;所述的SR5为盐溶液;
步骤10:用2mL SR5润洗柱子,将步骤8中悬起RNA的SR5转移,过柱子;用过1mL SR5清洗柱子,用1mL SR6将RNA从柱子上洗脱下来;
步骤11:将步骤10中的转移洗脱下来的RNA放置到2.2mL的收集管中,加入1mL的SR4,混合均匀,在20℃下孵育至少10min;
步骤12:将步骤11中的样品在4℃、13000g的离心力下将样品离心分离15min,丢弃上层清液;
步骤13:将步骤12中的样品倒立放置在滤纸上,干燥10min;
步骤14:在步骤13中的样品加入50-100µL THE RNA Storage Solution(Ambion) ,悬起RNA沉淀;
步骤15:通过RTS DNaseTM Kit (MoBio)移除步骤14中的样品基因组DNA;
步骤16:步骤15中的样品RNAs 存储在-80℃,方便后续分析。
2.根据权利要求1所述的高效土壤微生物总RNA提取方法,其特征在于,所述的SDS 作为去垢剂,破坏细胞膜上的脂肪酸、脂质。
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