[发明专利]一种孕期叶酸代谢、钙代谢及H型高血压联合检测方法在审
申请号: | 201910624055.2 | 申请日: | 2019-07-11 |
公开(公告)号: | CN110257507A | 公开(公告)日: | 2019-09-20 |
发明(设计)人: | 裘敏燕 | 申请(专利权)人: | 上海联吉医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 北京盛凡智荣知识产权代理有限公司 11616 | 代理人: | 魏蓓 |
地址: | 200000 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 联合检测 叶酸代谢 钙代谢 高血压 毛细管电泳技术 生物信息学软件 多重PCR引物 生物信息学 同源性分析 含量分析 技术结合 频度分析 探针系统 序列分析 序列信息 遗传分析 多重LDR 多重PCR 灵敏度 检测 分型 碱基 通量 检索 数据库 优化 分析 | ||
1.一种孕期叶酸代谢、钙代谢及H型高血压联合检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
Step.1样本基因组DNA的获取:用Qiagen DNA抽提试剂盒提取全血样本的基因组DNA;
Step.2试剂保存:将收到的试剂盒放置于-20℃的环境中保存,避免反复冻融;
Step.3 PCR扩增:取PCR Mix 5.5ul,PCR引物2ul,Taq酶1.2ul,基因组DNA 2ul,补水至15ul;PC扩增条件:预变性,95℃,10min;94℃30s,56℃90s,72℃1min,循环40次;终延伸,72℃,10min;PCR引物包括VDR,ESR1,MTHFR,MTRR,SLC19A1基因序列,引物组具有如SEQ IDNo:1-14所示的核苷酸序列;
Step.4 LDR连接:取Ligase Mix 0.5ul,探针0.5ul,连接酶1ul,PCR产物2ul,补水至5ul;预变性94℃,1min;94℃15s,50℃25s,循环40次;探针组具有如SEQ ID No:15-41所示的核苷酸序列;
Step.5毛细管电泳检测:取HIDI8.9ul,分子量内标0.1ul和连接产物2ul混合,95℃变性10min,冰浴冷却后上遗传分析仪3130XL,送样电压3KV,上样时间15sec;
Step.6结果分析:使用GeneMapper ID V3.2软件对毛细管电泳结果进行分析,统计9个SNP位点的分型结果。
2.根据权利要求1所述的一种孕期叶酸代谢、钙代谢及H型高血压联合检测方法,其特征在于:所述SLC19A1的SNP位点为rs1051266,突变位置NM_194255.2:c.80A>G(p.His27Arg;A80G)。
3.根据权利要求1所述的一种孕期叶酸代谢、钙代谢及H型高血压联合检测方法,其特征在于:所述VDR的SNP位点为rs1544410,突变位置S4((NM_001017535.1:c.1024+283G>A));rs731236,突变位置S2(NM_001017535.1:c.1056T>C);rs7975232,突变位置S1(NM_001017535.1:c.1025-49G>T)。
4.根据权利要求1所述的一种孕期叶酸代谢、钙代谢及H型高血压联合检测方法,其特征在于:所述ESR1的SNP位点为rs9340799,突变位置S1(NM_001122742.1:c.453-351A>G);rs2234693,突变位置S2(NM_001122742.1:c.453-397T>C)。
5.根据权利要求1所述的一种孕期叶酸代谢、钙代谢及H型高血压联合检测方法,其特征在于:所述MTHFR的SNP位点为rs1801133,突变位置NM_005957.4:c.665C>T(p.Ala222Val;C677T);rs1801131,突变位置NM_005957.4:c.1286A>C(p.Glu429Ala;A1298C)。
6.根据权利要求1所述的一种孕期叶酸代谢、钙代谢及H型高血压联合检测方法,其特征在于:所述MTRR的SNP位点为rs1801394,突变位置NM_002454.2:c.66A>G(p.Ile22Met;A66G)。
7.根据权利要求1所述的一种孕期叶酸代谢、钙代谢及H型高血压联合检测方法,其特征在于:所述探针组中的SEQ ID No 15、No 18、No 21、No 24、No 27、No 30、No 33、No 36、No 39为荧光标记探针。
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