[发明专利]一种病理图像的去除背景的方法

说明书

本发明公开了一种病理图像的去除背景的方法，包括，获取原图像，并将原图像缩放4倍；通过医学处理库Openslide对所述缩放后的病理图像处理；对所述低倍率图像中的组织进行二值化提取；选取所述组织碎片中面积大于每个组织最小像素面积的组织部分，并在低倍率图像上获得每一片组织轮廓；通过所述低倍率图形中的组织轮廓找到原图像上的组织轮廓位置，并获取所述组织轮廓位置；通过libvips对所述原图像进行图像处理，并得到去除背景后的图像。通过缩放图像后的低倍率的图像，去除了病理图像上的噪点后，通过删除背景部分的图像，从而节省了图像的存储空间，且不会对图像的展示产生影响。

技术领域

本发明涉及的图像处理的技术领域，特别是，涉及一种病理图像的去除背景的方法。

背景技术

因为目前接触的图像都属于莱卡所产生的SVS图片，目前的最大倍数为20x～100x，原图像上有很多噪点，而这些噪点对后续的图像处理以及算法实现都有很大的影响，因此需要将原图像中的背景去除，并且去除背景后的图像的大小也在减少，这些噪点严重的影响用户交互以及会产生的视觉障碍。

而一般操作时，SVS的图片较大，存储的信息量较为丰富，因此一般的图像处理算法很难对其进行处理操作。如果将原图大小的SVS图片以正常存储方式存储为JPG、PNG或者TIFF格式的话，原图大小为343M，即使能够转换为正常格式的话，但是其大小会变得很大(如转换为PNG格式后大小变为1.83G)，由于信息量很大(像素数很多)，导致即使配置很高的电脑打开文件也会很浪费时间，甚至于卡死。

因此，目前市场上的病理图像存在两个缺陷：

(1)病理图像上存在很多噪点，且噪点严重的影响用户交互以及会产生的视觉障碍；

(2)病理图像的图片存储的大小很大，容易使得电脑打开需要较长时间，若电脑配置较低，电脑甚至会卡死。

发明内容

本部分的目的在于概述本发明的实施例的一些方面以及简要介绍一些较佳实施例。在本部分以及本申请的说明书摘要和发明名称中可能会做些简化或省略以避免使本部分、说明书摘要和发明名称的目的模糊，而这种简化或省略不能用于限制本发明的范围。

鉴于上述和/或现有技术中存在的问题，提出了本发明。

因此，本发明其中一个目的是提供一种病理图像的去除背景的方法。

为解决上述技术问题，本发明提供如下技术方案：一种病理图像的去除背景的方法，包括，

S1，获取一张病理图像的原图像，并将原图像缩放4倍；

S2，通过医学处理库Openslide对所述缩放后的病理图像处理，并获得缩放4倍后的低倍率图像；

S3，对所述低倍率图像中的组织进行二值化提取；

S4，通过形态学闭操作将二值化提取后的图像进行内部填充形成一个完整的组织碎片；

S5，将所述组织碎片通过形态学开操作去除噪声点；

S6，选取所述组织碎片中面积大于每个组织最小像素面积的组织部分，并在低倍率图像上获得每一片组织轮廓；

S7，通过所述低倍率图形中的组织轮廓找到原图像上的组织轮廓位置，并获取所述组织轮廓位置；

S8，通过libvips对所述原图像进行图像处理，并得到去除背景后的图像。

作为本发明所述病理图像的去除背景的方法的一种优选方案，其中：所述二值化提取的步骤分为三步：

S401，将低倍率图像转换到HSV空间，并提取饱和度的通道信息；

S402，对所述低倍率图像进行均值滤波，卷积核大小为100*100，去除小的噪点；