[发明专利]辣椒疫病抗性基因SNP标记5-156及其特异性引物和应用

说明书

本发明属于农业生物技术领域，具体涉及辣椒疫病抗性基因SNP标记5‑156及其特异性引物和应用。本发明确定了辣椒基因组中与辣椒疫病抗性形状相关的SNP位点，应用上述SNP位点，只需在苗期对辣椒植株的DNA检测，就可对辣椒疫病抗性基因进行判断，可以广泛应用到分子标记辅助育种中。

技术领域

本发明属于农业生物技术领域，具体涉及辣椒疫病抗性基因SNP标记5-156及其特异性引物和应用。

背景技术

辣椒疫病是影响辣椒生产的主要病害之一，由辣椒疫霉菌(Phytophthoracapsici Leonian)引起，辣椒被疫霉菌侵染后可出现根系坏死，茎、叶和果实腐烂等症状，造成严重损失。经杂交引入疫病抗性基因是培育辣椒抗病品种的主要手段，该方法的难点在于辣椒材料对疫病的抗性遗传规律多样，主要由2个或2个以上多基因控制、单显性基因控制和单显性基因加修饰基因控制模型，并且抗性基因具有小种特异性和危害症状特异性特点。

分子标记辅助育种基于基因型筛选种质资源，避免或降低表型选择的误差，能大大缩短育种进程，是提高转育准确性和效率的重要手段。现有技术公开了多个辣椒疫病抗性分子标记，然而，这些分子标记也存在基因型与表型不一致等问题，影响其在材料筛选和分子标记辅助育种中的应用。针对不同抗性材料开发与相关基因连锁更紧密、适合性更高、检测更高效的分子标记有助于辣椒疫病抗性材料的选择和品种选育。

发明内容

本发明的目的在于提供一种辣椒疫病抗性基因SNP标记5-156。

本发明的再一目的在于提供上述SNP标记的KASP特异性引物。

本发明的再一目的在于提供上述SNP标记和引物的应用。

本发明的再一目的在于提供鉴定抗疫病辣椒的方法。

本发明的再一目的在于提供鉴定抗疫病辣椒的检测试剂盒。

根据本发明具体实施方式的辣椒疫病抗性基因SNP标记5-156，所述SNP标记的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，其中SEQ ID No.1所示序列的第24位碱基用W表示，W代表为T或A。

SEQ ID No.1：

ATGAATTGCAACTTTTTTCTCCAWGGAAGAACAAATCACCTCCAAA

根据本发明具体实施方式的辣椒疫病抗性基因SNP标记5-156的KASP特异性引物，5-156引物序列如下：

前引物A1:5′-ATGAATTGCAACTTTTTTCTCCAT-3′,

前引物A2:5′-ATGAATTGCAACTTTTTTCTCCAA-3′,

后引物C:5′-TTTGGAGGTGATTTGTTCTTCC-3′。

根据本发明具体实施方式的KASP特异性引物，所述前引物A1、A2的5’端加有荧光标签，其中，所述前引物A1的5’端加有FAM荧光标签序列，所述前引物A2的5’端加有HEX荧光标签序列。

根据本发明具体实施方式的KASP特异性引物，所述FAM荧光标签序列为5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCT-3’，所述HEX荧光标签序列为5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATT-3’。

本发明提供辣椒疫病抗性基因SNP标记的应用，尤其是在辣椒分子标记辅助育种中的应用。

根据本发明具体实施方式的鉴定抗疫病辣椒的方法，其包括应用辣椒疫病抗性基因相关的SNP标记5-156鉴定待测辣椒材料的疫病抗性的步骤：