[发明专利]鉴别细菌感染的方法

说明书

鉴别细菌感染的方法。本发明涉及基于测定样品中的一种或多种细胞和/或体液标志物，用于鉴别来自腹膜样品的细菌感染性质的方法，具体而言，所述细菌感染是革兰氏‑阴性还是革兰氏‑阳性感染。

发明领域

本申请涉及至少一种用于鉴别来自腹膜样品的细菌感染性质的方法，具体而言，所述感染是否由革兰氏-阳性和/或革兰氏-阴性细菌引起。更具体地，所述方法涉及鉴别所述样品中一种或多种细胞和/或体液标志物的相对量。进一步，所述发明涉及治疗方法，其涉及所述方法的使用，理想地允许在选择治疗方案和/或监测成功治疗效果中做出知情决策。

发明背景

细菌感染依然是世界各地的发病率和死亡率的主要原因，尤其由于耐抗生素的病原菌的空前蔓延。而且，标准诊断的不良表现阻碍有效的感染控制，并且因此关于有效治疗的使用作出不恰当的选择。这种令人恐慌的情形正引起对临床实践，公共卫生和生物医学研究的巨大挑战。

疑似感染的当前诊断和治疗主要取决于可能的微生物病原体的阳性鉴定，该概念在一个多世纪前由Robert Koch引入但从那以后没有被改变。细菌感染的致病病原体的阳性鉴定不仅对指导和改善关于抗生素治疗选择的患者管理是关键性的，而且它提供给我们关于背后的炎症机制以及如何操作这些机制以帮助解决感染的重要线索。

目前，检测和定性感染微生物需要经典的微生物学培养技术、基于光谱的分析和/或高度复杂的核苷酸鉴定方法。Mohan et al.2011描述了核苷酸检测和免疫分析检测的组合使用，例如，“针对在37℃杂交所优化的寡核苷酸探针便于与免疫分析整合”来诊断尿路感染[5]。Podsiadly et al.2005描述了检测特异性肺炎衣原体(Chlamydia pneumoniae)IgM、IgG和IgA血清抗体的水平以诊断尿路感染[6]。这些后面的分析被认为是不可靠的。

而且，与对常规培养技术依赖相关的固有延迟明显地阻碍病原体鉴定。治疗医生获得结果以能够特异性的和靶向的治疗通常需要两天或甚至更久。在一些疾病中，如肺结核，这需要高达两个月。更重要地，在很多情况下，通过传统的方法不能培养细菌，这意味着患者临床症状背后的原因依然未知。

通常，当明显的临床症状出现时，感染只是表面的。有效的和特异的治疗干预取决于致病微生物的早期检测和鉴定。照惯例，基于症状、起初的临床发现和炎症的其他基本实验室标志物(如C-反应蛋白)确定患者处理。该方法通常是欠佳的因为太笼统并且缺乏特异性。通过微生物鉴定和抗生素敏感性试验通常仅获得增加的特异性，并且这可伴随感染最佳处理的延迟。使用广谱抗生素以覆盖多种可能的发病原因的趋势促成其他严重问题如艰难梭菌(C.difficile)感染，以及细菌耐药性的发展。因此，存在明显的临床需求以实现感染的较早和较好的检测和定性以1)改善患者结果；2)改善特异性抗感染药的使用；以及3)降低抗菌素耐药性和其他严重感染的发展。能够实现这种效果的技术会提高患者体验，并且确保患者处理的更持久更经济有效的方法。

腹膜透析(PD)为用于具有严重慢性肾脏疾病的患者的治疗。疗法涉及经Tenckhoff管将专门的透析液引入腹腔，目标是通过流体产生的透析梯度去除累积在肾脏上的难以扩散的毒素和水。两个过程同时地发生在半渗透的腹膜上。富含葡萄糖的透析液的感染导致腹膜炎，为PD的主要并发症，其具有明显的发病率和死亡率牵连。