[发明专利]一对高多态性石榴SSR引物及其应用

说明书

本发明公开一对高多态性石榴SSR引物PG098，包括正向引物和反向引物，正向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，反向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明提供的引物对PG098多态性高，利用其对22个石榴品种DNA进行扩增，仅SXXA1可特异性的扩增出215bp的条带；还可根据条带大小对AHHB24、HN06、HN11、HN13、HY04、HY05、HY25、SD20、SD27、SD57、SXXA09、SXXA16、SD16、SD59品种进行区分。

技术领域

本发明涉及分子标记技术领域，具体涉及一对高多态性石榴SSR引物及其应用。

背景技术

石榴是古老的保健水果，果实富含花青苷、黄酮、安石榴苷等多酚类物质，特别是安石榴苷等鞣花单宁类物质临床医用和保健价值高，具有潜在的抗氧化、抗癌、抗菌等功能，被誉为超级水果，被划为国家规划特色经济林树种之一。石榴在中国有2000多年的栽培历史，不同地域间的引种和品种交换频繁，导致了现有品种间混杂，同物异名或同名异物现象非常普遍。品种混杂，不仅给育种亲本选配带来了困难，对生产中大规模引种也造成了严重影响，一定程度上制约了石榴产业的快速健康发展，因此，开展石榴品种鉴定是生产中需要解决的重要课题。

目前，对石榴品种的鉴定主要是通过表型特征，包括树势、叶、花、果实等特征，这些表型特征易受到环境因素影响。分子标记可以直接检测不同品种或个体在DNA分子水平上的差异，具有较高的多态性和个体特异性，且不受环境和生长阶段影响，能鉴定形态标记所难以鉴定的个体。SSR分子标记数量丰富且随机均匀分布于基因组中，呈共显性，等位变异高，检测方便，已应用于苹果、葡萄、水稻等品种鉴定中应用。石榴中开发特异性强、多态性高、能稳定鉴定石榴品种的SSR引物对科学合理利用石榴品种具有重要的意义。

发明内容

本发明第一方面提供了一对高多态性石榴SSR引物PG098，包括正向引物和反向引物，正向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，反向引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。

本发明第二方面提供了上述引物对PG098在石榴育种中的应用。

本发明第三方面提供了上述引物对PG098在石榴品种鉴定中的应用。

本发明第四方面提供了上述引物对PG098在石榴SXXA1、AHHB24、HN06、HN11、HN13、HY04、HY05、HY25、SD20、SD27、SD57、SXXA09、SXXA16、SD16、SD59品种鉴定中的应用。

本发明的有益效果：

1.本发明提供的引物对PG098特异性强，利用其对22个石榴品种DNA进行扩增，仅SXXA1可特异性的扩增出215bp的条带。

2.本发明提供的引物对PG098多态性高，除了可根据特异性条带鉴定SXXA1品种，还可根据条带大小对AHHB24、HN06、HN11、HN13、HY04、HY05、HY25、SD20、SD27、SD57、SXXA09、SXXA16、SD16、SD59品种进行区分。

3.利用引物对PG098开展的品种鉴定技术具有取材方便、鉴定技术简便快速、结果高度准确稳定的特点。本方法可取叶、花、果实、芽等组织或器官，苗木或多年生植株均可取样，不受季节、地点限制。该技术是利用PCR扩增结果进行毛细管电泳即可判读结果。检测结果也高度准确稳定。

具体实施方式

下面结合实施例对本发明做更进一步地解释。下列实施例仅用于说明本发明，但并不用来限定本发明的实施范围。

实施例1

用于石榴品种鉴定的SSR引物对PG098的获得：